字德埙，号素庵，江苏嘉定人。光绪十三年(1887年)从苏州名医曹沧州学医，学成归里，在善德堂及宝山县吴淞镇行医。光绪十七年迁居上海，设诊所于九江路。余氏精通医理，擅长内科，对热病、调理诸方面颇有造诣，名盛一时。民国初年，孙中山曾慕名延其诊视，给予褒奖。
光绪三十二年(1906年)，余氏参与创立上海医务总会，任会董。辛亥革命爆发后，余发起组织上海医界助饷团，资助革命。民国2年(1913年)与包识生创办神州医药总会，任会长，并与包氏共同主编《神州医药学报》。同年北洋政府教育会议颁布各类教学课程，独不列中医教育，翌年余氏与包等发起组织“医药救亡请愿团”，赴北平，向北洋政府递交请愿书。民国7年又在上海创办神州医药专门学校，任校长。著有《疫症集说》、《鼠疫扶微》、《救急便览》诸书。