对已有的研究结果进行定量综合的分析，试图确定“真实”值。除了下列专用软件之外，通用软件如Stata、SAS、SPSS、R、Splus、WinBUGS等，也有一些模块或宏命令，能够进行元分析。
软件
主要功能
版本
平台
地址
Comprehensive Meta Analysis
自动计算效应规模
2.0
win9.x
商业软件
Easymeta
2001
dos
免费软件
Epi Meta
dos
免费软件，已经停止更新
Meta-analysis
计算精确概念和效应规模
5.3
dos
免费软件，主页上手册
Meta-DiSc
评估临床和筛选检验的结果
1.1.1
win9.x
免费软件
Meta-Test
计算单个研究的敏感度（sensitivity）和特异度 （specificity）
0.6
dos
免费软件
MetaWin
计算随机效应和固定效应模型，使用参数和再抽样两种估计方法
2.2
win9.x
商业软件
Review Manager (RevMan)
4.2.8
win9.x
免费软件