三井寺（圆城寺）位于日本大津市别所，为日本天台宗寺门派之总本山，与称“山门”之延历寺相对而称寺门。山号长等山。通称御井寺、三井寺。
674年弘文天皇皇子大友与多王所创建。859年圆珍（智珍大师）再度兴建，作为延历寺之别院，且改别当之职称为长吏。然，未久与圆仁之门徒发生争斗，圆珍之门徒遂于993年撤离延历寺，而以本寺作为根据地。其后历遭烧毁，至1599年丰臣秀吉再建金堂，而由德川氏保护之。
“三井寺”始建于672年，原名“圆城寺”。日本天台宗五祖圆珍（智珍大师）853年来到唐朝，在天台山国清寺研习天台章疏。856年再次到天台山，在国清寺止观院建立一堂，题名“天台山国清寺日本国大德僧院”。 从唐朝回到日本后，圆珍于859年成为三井寺第一任住持长吏。应该正是此时，圆珍取自天台山“三井潭”的灵感将“圆城寺”更名为“三井寺”。
天台寺宗门的大本山。院内保存有被称作阏伽井的井，据传天智·天武·持统的3帝出生时，就是用这里的井水洗净身体的。所以这里也被称作「御井寺」，后通称「三井寺」。正殿金堂被指定为国宝，除此之外，释迦堂，三重塔，唐院等殿宇巍然耸立，共有国宝及重要文化财100多件。
