巨野教案亦称曹州教案（菏泽曾称曹州）。清光绪二十三年十月十七日(1897年11月1日)长期积怨饮恨，饱受压近期凌的劳苦人民，忍无可忍，在磨盘张庄教堂内杀死了两个德国洋教士，朝野上下，一片震惊，外国洋人闻之丧胆，这是中国人民反对外来侵略和封建官府压迫具体体现。
鸦片战争以后，英，法，美，德，日等这些帝国主义国家相继侵入中国，他们用洋枪火炮打败了腐朽的清政府，迫使签订了一个个丧权辱国的不平等条约，使中国迅速沦为半殖民地的国家。特别是在1896年前后，外国列强在我国神圣国土上任意划分势力范围，对中国加紧进行军事，政治侵略和经济掠夺，并派入大批传教士对我中华民族进行精神腐蚀和文化渗透，清政府逆来顺受，屈膝求和。在巨野，传教士及其教徒肆无忌惮，横行乡里，敲诈勒索，作恶多端，清朝官吏畏之如虎，敬若上帝，是非混淆，百般袒护。百姓们饮恨吞声，积怨痛恨，遂至一发而不可制，终于爆发了震惊中外的巨野教案。1897年11月1日夜，阴云密布。十多个手拿匕首，短刀的人，闯进磨盘张庄教堂，杀死了德国神甫能方济和韩理迦略。能、韩二人原本分别在阳谷和郓城一带传教，因去兖州天主教总堂参加"诸胜瞻礼"，路此天晚而宿。张庄教堂神甫薛田资，主让客先，安顿能，韩二人成了替死鬼。薛田资听到动静后发现情况不妙，仓惶逃往济宁，电告德国驻华大使并转德国政府。
1897年11月13日，即教案发生后的第12天，德政府派军舰多艘，强行占领胶州湾，迫使清政府签订了丧权辱国的中德《胶澳租界条约》。惩办了山东巡抚李秉衡、兖沂曹济道锡良、曹州镇台万德力、巨野知县许廷瑞等近十名地方官；赔银20万两，并在巨野，济宁，曹州等地建造教堂及传教士防护住所。从此山东成了德国的势力范围，正如当时日本《外交时报》所称：华政府于山东一举一动，皆受德人指使，似满洲之实权归俄人掌握彼山东之实权，亦将归诸德人矣。
巨野教案已成为历史长卷中的一页，它记载着中国人民反帝反封建斗色的光辉史迹。也饱含着外来侵略的欺凌和耻辱，这一切将被中华民族后世子孙永远铭记在心。
巨野教案遗址位于山东省菏泽市巨野县城东北10公里的麒麟镇磨盘张庄村内，为省级重点文物保护单位。可惜的是，磨盘张庄教堂于1967年被拆除，唯甫用的椅子，大床，教堂门窗幸存，为县文物管理所收藏，原教学遗址公存当年水井一眼。1977年，巨野教案遗址被公布为省级重点文物保护单位。
德国以巨野教案为借口，侵占了山东胶州湾。
