2001 年 6 月，山东大学经济研究院组建， 教育部“长江学者”特聘教授黄少安博士任院长。其前身是 1996 年成立的山东大学产权研究所。它是直属山东大学、独立建制的科研和研究生培养机构。
经济研究院以 “ 崇尚经济科学、培养优秀人才、服务社会进步 ” 为宗旨，坚持兼容并蓄、自由发展。现有理论经济学和应用经济学两个一级学科博士、硕士学位授予权，其中理论经济学设有教育部“长江学者”特聘教授岗位。理论经济学博士生近期招生的专业包括政治经济学、经济思想史、经济史、西方经济学、 世界经济、人口资源与环境经济学和法经济学（自设）、语言经济学（自设）；应用经济学博士生近期招生的专业包括金融学、数量经济学、产业经济学、劳动经济学、国民经济学、区域经济学等。同时接受在职申请学位和面向企业、政府等，从事经济咨询、人员培训、企业诊断、规划制订等，也面向高等学校举办师资培训班。现在研究生生源结构非常好、就业理想。
政治经济学和金融学是“211”工程和“985”工程重点建设的学科或平台；已有省级重点学科政治经济学、数量经济学、产业经济学等， 其中政治经济学为强化建设的重点学科 ；有省级重点强化建设人文社会科学研究基地——产权理论与法经济学研究基地；山东省社科规划办公室2004年批准的省级重点人文社科研究基地——产权理论与产权制度改革研究基地。
研究院有一支年轻精干、富有创业精神的优秀学术队伍，优秀青年学者 黄少安教授、 盛洪 教授等在此工作。还有魏建（教育部新世纪优秀人才）、孙天琦等后期之秀。现有人员全部为来自国内外名牌大学的博士，不同大学的文化、学术风格在此汇聚、交融。她是一个开放的学术园地，有一个开放的机制，有专职人员和兼职人员，以专职人员为主。海内外一批著名学者在此实质性兼职工作。校内外、海内外的学者都可以带课题来研究，也有一些课题公开招标。也给学者们提供自由表达学术思想的讲坛。
研究院对理论经济学和应用经济学同等重视，已经在产权理论和制度经济学（包括法经济学）、一般均衡理论、金融数学与金融工程、经济周期与经济增长理论、公共经济学、人力资本理论等领域取得了一些重要的基础性的研究成果。特别注重学科交叉与融合，主要表现为经济学与法学、金融学与数学、经济学与环境科学、经济学与史学（经济计量史学）的交叉与融合，特别是 “ 金融理论与金融工程 ” 的研究，充分体现了山东大学金融数学和经济学的优势互补。也强调应用与开发研究，已经面向中国的经济实践做了一批案例研究，并为企业和政府提供了一系列对策性成果，被政府和企业所采纳。近年来，研究院（中心）人员已经在《 Econometrica 》、《中国社会科学》和《经济研究》发表论文 40 多篇，出版了一系列重要专著。黄少安教授先后获孙冶方经济学奖、首届中国 农村发展研究奖等。魏建教授等多次获得省部级一等奖。
研究院现下设产权研究所、金融理论与金融工程研究所、法经济学研究所、投资研究所、数量经济学研究所、国际经济研究所、 就业与社会保障研究所、 新经济史学和经济史研究所、 企业经营革新研究所、 “ 三农 ” 问题研究所、语言经济学研究室、经济周期与经济增长研究室、教育经济学研究室等研究部门。
研究院主办（ 黄少安 教授主编）有《制度经济学研究》杂志，暂时为季刊；另外，还主办《山东大学研究生经济学刊》，为经济、管理类研究生提供了一个从事学术研究和交流的平台。
研究院有着广泛的国际国内合作。与北美、澳洲、欧洲的10多所著名大学有良好的、富有成效的合作关系，在科学研究、研究生培养等方面有实质性成果，每年都输送优秀学生去著名大学攻读博士学位或联合培养或访问学习。
