运输管理系由原机车专业和运输管理专业发展起来的，始建于1956年，经过半个多世纪的发展，为全国铁路企业培养了6000多名专业技术人才，部分毕业生已经走上中、高级领导岗位；作为铁路企业的战略合作伙伴（运输系统员工培训基地），该系承担着大量运营管理人才的培训任务，先后培训了运输调度指挥、车站站长、车站技师等各类人员5000多人，为铁路的发展作出了积极的贡献。
运输管理系师资力量雄厚，其中副教授占51%，硕士研究生占55%，“双师型”教师占95%。 该系教师在国家、省、部级刊物发表了大量学术论文；完成和参与完成国家、省、市多项研究课题；主持和参编国家、部规划教材10余部。已形成了职称、学历、年龄结构合理，具有开拓创新精神的教师团队。
该系十分重视学生的技能训练，建有十多个铁路现场校外稳定的实训基地和“接发列车与调度指挥演练室”、“车站行车组织演练室”、“货运演练室”、“客运演练室”及“运输设备试验室”等校内实训基地，其中“接发列车与调度指挥演练室”在全国轨道交通职教领域具有领先地位；学生40% 的时间用于铁路运输企业“五大基本工种”的技能训练和各工种的分类实习，学生毕业时经考核可获得国家高、中级职业资格证书。该系已成为我国铁路跨越式发展和城市轨道交通运输快速发展高技能技术人才培养的重要基地。
毕业生主要面向铁路、城市轨道交通企业的运输部门，从事交通运输基层站段的运输生产经营、组织指挥和管理工作。
1、铁道交通运营管理专业
培养目标：本专业主要面向铁路、地下铁道及大型厂矿企业和港口铁路运输企业，培养具有铁路运输生产与调度指挥等综合职业能力的高等技术应用型、复合型专门人才。本专业师资力量雄厚，双师素质的教师达90%，专业教学十分重视技能训练，校内建有车站行车综合实训室、接发列车与调度指挥模拟演练室等实训场所，广州铁路集团公司调度所、合资铁路公司及十多个（大）车站、车务段为校外稳定的实训和就业基地，学生在校期间约有40%的时间用于铁路行车调度指挥、接发列车、调车工作三大基本工种的技能训练，同时可取得国家相关工种中高级岗位职业资格证书。
主要课程：铁路运输设备、铁路线路与站场、铁路行车组织、铁路行车规章、铁路行车安全、地下铁道运营组织等。
就业方向：本专业培养的毕业生主要面向铁路运输企业行车关键岗位，从事铁路运输基层的操作、组织、管理及指挥工作，也可胜任城市轨道运输组织、管理等岗位工作。
2，铁道运输经济专业
培养目标：本专业主要面向铁路、地下铁道及大型厂矿企业和港口铁路运输企业，培养旅客、货物运输生产组织与服务等综合职业能力的高技能应用型人才；本专业师资力量雄厚，双师素质的教师达90%，专业教学十分重视技能训练，校内建有车站“货运演练室”、“客运演练室”等实训场所，广州铁路集团公司十多个（大）车站、客运（车务）段及合资铁路公司是稳定的实训和就业基地，学生在校期间约有40%的时间用于客货运输与服务的三大基本工种的技能训练，同时可取得国家相关工种中高级岗位职业资格证书。
主要课程：铁路客运组织、铁路旅客运输服务、铁路货运组织、集装箱运输、运输经济、市场营销、地下铁道运营组织等。
就业方向：本专业培养的毕业生主要面向铁路运输企业的客货运输窗口岗位，主要从事铁路运输企业的客货运输生产组织、经营工作，也可胜任城市轨道运输经营、管理等岗位工作。
