屏东航空站于1994年11月底成立，初期借用屏东县立化中心作为临时候机室，再以交通车接驳的方式，将搭机旅客载送至屏东空军机场上下飞机。到了1995年2月迁至屏东空军基地南机场大门左侧服务旅客，此为位于胜利路的简易航空站，直到2005年5月，新航厦完工后，才迁移至位于忠孝路上的屏东空军基地北机场现址营运。
而新机场航厦耗时3年，于2005年5月17日正式落成启用，尽管出现不少“浪费”、“大而无当”的质疑，不过对常来往于台北与屏东间的旅客，新机场比原先的军用机场更靠近市区，位于台3线要道上亦较多路线公共汽车经过，相对地也更节省交通往返的时间与金钱。
跑道︰民航机所使用的北跑道长度2,442米，宽45米。
滑行道：长度2,337米，宽度23米。
停机坪：面积34,034平方米，配置MD90停机位3架位，直升机停机位5架位。
场站：航厦面积7,103平方米。尖峰小时出入境人数设计为474人次/小时。
目前只有台北—屏东1条航线，由复兴航空独家经营，该公司以74人座的ATR72-200/500飞航此条航线，每日固定一个来回班次，总计每周有七个架次。
