又叫双名命名法，是瑞典生物学家林奈创立的。每种植物的学明必须由两个拉丁词或拉丁化形式的词构成。第一个词为属名，第二个词为种加词。属名一般用名词单数第一格，种加词一般用形容词，并要求与属名的性、数、格一致。双名法的书写形式是：属名的第一个字母必须大写，种加词全为小写，此外，还要求在种加词后写上命名人的姓氏或姓氏缩写，第一个字母也要大写。如：向日葵：Helianthus annuus L. 。如果命名人有两个，则在两个人姓氏之间加“et”如果加“ex”则表示前一个是命名人，后一个是著文公开发表这个种的人。
双名法则创立的伟大意义18世纪以前，人们认为大自然就是丰富多彩的野生动植物世界。而卡尔·林奈却在看似无序的自然界发现了秩序和条理。他建立了为动植物命名和分类的体系，从概念上对不同种类的动植物加以区分，这一体系帮助科学家们深入理解植物学、生物学、生态系统以及生物结构，直到将近300年后，他们还在依靠这个体系。
林奈因为他的发现而被称为“现代分类学（taxonomy）之父”（“taxonomy”是希腊语，意思是“按顺序命名”）。我们可以从两个方面来理解林奈对现代科学的影响和重要性。第一，全部科学仍然沿用他创立的体系，仍然和他一样用拉丁语命名现存的和新发现的物种——这也是这门科学曾经通用的古老语言留在世界上的最后痕迹。新发现的物种都依照林奈的体系命名和归类。第二，所有生物学家都运用林奈的体系来辨别、理解、划分以及指称动植物物种。
林奈是最早确定人类为“智人”的科学家，他把人类归为灵长类动物。他的分类体系是“生命树”的起源，因为任何生物都属于某一种、属、科、纲、目、门，都从属于动植物王国——就如同一棵树的枝、叶和树干都是这棵树的一部分一样。
双名法则的创立过程卡尔·林奈痛恨杂乱无章。他曾经说过，他无法理解不系统的事物。他1707年出生于瑞典，家人希望他长大后能像父亲一样成为一名神父。但是对神职卡尔没有表现出有多少资质和兴趣，因此家人最后允许他转行学医。
1727年他进入隆德大学医学院学习，可是他花在学校小植物园的时间却比在教室还多。从小他就非常热爱花草树木。1728年林奈转到了乌普萨拉大学（部分原因是这个大学里有更大的植物园）学习。在那里他读了法国植物学家塞巴斯蒂安·瓦扬（Sebastian Vaillant）的一篇论文，论文宣称（当时这个创新令人震惊），植物是有性繁殖的，如同动物有性器官一样，植物也有雄性和雌性之分。
塞巴斯蒂安·瓦扬的观点吸引了林奈。作为编目人，他反对植物园里成千上万的植物都是各自独立的物种的主张，开始设想把繁殖器官的不同作为植物分类的依据。他梦想着给混乱的自然界建立一种秩序。
林奈天生能说会道，热情诚恳，他为自己赢得了强有力的支持者，给他提供足够的财力支持，这样他就能在瑞典各处进行探险，研究各种植物并给它们编目。他花费数月时间走遍乡下各地，记录他所见到的植物，然后进行详尽的描述和研究。他的探险按部就班，每天早晨7点准时出发，下午2点停下来吃午饭，4点休息、讲解。
在探索过程中，林奈集中研究了植物的繁殖系统。很快，他发现许多植物都有共同的雄性和雌性特点，他把它们归为一类。他把相似的种类合在一起组成更大的类。他发现，根据几个重要特性完全可以把植物分类，自然界确实是存在秩序的。
到1735年为止，他已经记录了4000多种植物，并且把他的分类体系在《自然系统》一书中发表。林奈的分类系统分为8个层次：种、属、科、目、纲、亚门、门和界。这种分类法——创立的唯一根据是植物和（后来的）动物的性元素——引起了很大争议。但是植物学家发现这个方法简单易行，很有吸引力。
林奈的分类法很快传遍了欧洲，且经常被画成树的形式：大树枝是纲，上面的小树杈是种。“生命树”的概念就是由这幅图而来的。
后来的30年中林奈在欧洲游历，为他的体系补充新的物种。1740年他把动物物种添加到这一体系中。到1758年，他的分类体系已经包含4400种动物和7700多种植物。
1758年，他在书的第十版引入了二名制（双名）命名法，用种名和属名为动植物命名。双名命名法完善了林奈的分类体系。他发现了自然界存在的秩序，并且建立了体系来描述这一秩序。直到现在，这个体系仍然富有生命力，仍为人们所用。
