医院信息系统（Hospital Information System），亦称“医院管理信息系统”，是指利用计算机软硬件技术、网络通信技术等现代化手段，对医院及其所属各部门的人流、物流、财流进行综合管理，对在医疗活动各阶段产生的数据进行采集、储存、处理、提取、传输、汇总、加工生成各种信息，从而为医院的整体运行提供全面的、自动化的管理及各种服务的信息系统。
什么是医院信息系统（HIS）？
对于医院信息系统（Hospital information System，HIS），美国该领域的著名教授Morris.Collen曾作如下定义：利用电子计算机和通讯设备，为医院所属各部门提供对病人诊疗信息和行政管理信息的收集、存储、处理、提取及数据交换的能力，并满足所有授权用户的功能需求。
既包括医院管理信息系统，又包括临床医疗信息系统：
医院管理信息系统(Hospital Management Information System,HMIS)的主要目标是支持医院的行政管理与事务处理业务，减轻事务处理人员的劳动强度，辅助医院管理，辅助高层领导决策，提高医院的工作效率，从而使医院能够以少的投入获得更好的社会效益与经济效益，象财务系统、人事系统、住院病人管理系统、药品库存管理系统等就属于HMIS的范围。
临床信息系统(Clinical Information System,CIS)的主要目标是支持医院医护人员的临床活动，收集和处理病人的临床医疗信息，丰富和积累临床医学知识，并提供临床咨询、辅助诊疗、辅助临床决策，提高医护人员的工作效率，为病人提供更多、更快、更好的服务。象医嘱处理系统、病人床边系统、医生工作站系统、实验室系统、药物咨询系统等就属于CIS范围。
单位HIS的总体结构
（1）临床诊疗部分:医生工作站,护士工作站,临床检验系统,医学影像系统,输血及血库管理系统,手术麻醉管理系统
（2）药品管理部分:数据准备及药品字典,药品库房管理功能.门急诊药房管理功能.住院药房管理功能.药品核算功能.药品价格管理.制剂管理子系统.合理用药咨询功能
（3）经济管理部分:门急诊挂号系统.门急诊划价收费系统.住院病人入、出、转管理系统.病人住院收费系统.物资管理系统.设备管理子系统.财务管理与经济核算管理系统
（4）综合管理与统计分析部分:病案管理系统.医疗统计系统.院长查询与分析系统.病人咨询服务系统
（5）外部接口部分:医疗保险接口.社区卫生服务接口.远程医疗咨询系统接口
