双链DNA中含有的二个结构相同、方向相反的序列称为反向重复序列，也称为回文结构，每条单链以任一方向阅读时都与另一条链的序列是一致的，例如5'GGTACC3' 3'CCATGG5'.
回文结构序列是一种旋转对称结构，在轴的两侧序列相同而反向。当然这两个反向重复序列不一定是连续的。
短的回文结构可能是一种特别的信号，如限制性内切酶的识别位点。较长的回文结构容易转化成发夹结构。
回文结构在某些因素作用下，可形成茎环式的十字形结构和上面提到的发夹结构，这些结构形式都可以互相转变。回文结构普遍存在于细胞的DNA分子中，它们与遗传信息表达的调控和基因转移有关