二因素论忽略了一个重要的事实，即，遗传与环境之间必须通过复杂的相互作用才能生成行为，这便是交互作用论。 遗传与环境因素作用的相互依赖表现在很多方面：
首先，分子遗传学的研究表明，染色体并非静态的结构，它是终于分子内的物质环境相互作用着，基因也存在移位和变异等变化。所以遗传的影响并不是在受精卵形成的时候就一劳永逸地确定了。
其次，基因的作用存在于这个时间表，该时间表决定着基因的作用什么时候开启，什么时候关闭，而机体内外的环境因素是影响时间表发挥作用的重要因素。
最后，遗传的作用离不开环境因素，遗传所决定的只是一种倾向性和易感性，而个体是否表现出遗传的性状或心理特征，还要取决于环境因素。
因此，遗传与环境因素之间是互相依赖与影响的。现代发展心理学已经认识到，探讨遗传与环境对心理发展的影响的最好方式，应该是去了解遗传和环境因素在具体的心理发展过程中是怎样交互作用的。在"遗传与环境之争"(nature and nurture debate)中，交互作用的观点已经成为当今发展心理学中的一种共识。
