浮游植物流式细胞仪利用流式细胞测量技术，在野外现场快速对水体中的浮游植物进行计数的仪器。与传统的生物医学流式细胞仪相比，具有如下显著特点。
1）细胞粒径范围大，可测量0.4 um－4000 um间的浮游植物，几乎覆盖自然界的所有浮游植物粒径范围
2）检测器强大，目前一台标准的浮游植物流式细胞仪CytoBuoy配备6种检测器：前向光散射（FSC）、侧向光散射（SSC）、红色荧光、绿色荧光、橙色荧光和曲度检测器。可以对浮游植物进行分类。
3）坚固、耐用、轻便，适合野外现场测量，而传统的流式细胞仪非常笨重，只能实验室内使用。
4）样品不需任何前处理，可以直接测量。传统的流式细胞仪前处理复杂，处理不好就会阻塞管路。
5）不需外加鞘液，仪器自动采用水样的滤液为鞘液，维护方便。
6）多版本可选。有便携式机型CytoSense、在线监测型CytoBuoy和水下型CytoSub。
7）可建立浮游植物专家库，可对自然界水样中的特点浮游植物（如易引发赤潮的硅藻和甲藻）鉴定到种，进行早期预警
8）新增成像功能，可拍摄特定细胞的显微照片。