中国医学在传入日本后被称为汉方医学或东洋医学。但中国医学进入日本的确切时代，至今还并不十分清楚。比较公认的是在公元5世纪时，朝鲜使者用中医药治愈日本天皇的疾病，使日本人认识到中国医学的价值，并且接受了这一医学体系，成为日本汉方医学的起源。直接交往始于6世纪。梁元帝于公元552年赠给日本《针经》一套，10年后，吴人知聪携医药书籍164卷到日本，中日医学的直接交流由此开始。 隋唐之际，中国走向强大兴盛，成为亚洲政治、经济、文化、医药的中心，两国医学交往遂日益频繁。公元608年，日本派遣药师、留学生来中国学医，历时15年学成回国，带回大量医书；而公元754年唐高僧鉴真又携带大批医书东渡日本，这些文献对日本医学的发展起到了重大的推动作用。此后隋唐、宋代医学及医药著作大量源源不断地传入日本，成为日本医学的主流。成书于我国唐代时期的《大同类聚方》、《医心方》等巨著就是日本医学家或参照、或直接引用中医书籍编纂而成。
到了我国明代，日本田代三喜（公元1465～1537年）到中国拜增月湖为师，留学12年回国后，极力推广东垣丹溪之学。其弟子曲直徵道三建立启迪院收门徒800余名，金元医学遂逐渐遍及日本各地。1571年，曲直徵道三代表作《启迪集》问世，该书引用中国医书达63种之多，金元医家的著作占了很大比重。追随他的弟子大多成为当时名医，中国医学也由此日本化。在这一时期，日本医家多推崇我国金元医学，崇尚温补、滋阴，而不甚重视《伤寒》等古籍，被称为后世方派。
及至我国明代末叶和清代，日本的江户时代（公元1603～1876年），日本医学界掀起了研究仲景医学的浪潮。代表人物吉益东洞所著《类聚方》、《药征》等著作，就是以《伤寒杂病论》的精髓结合自身经验编撰而成，形成了学术上的古方派，成为汉方医学之主流，并与后世方派在学术上产生论争，使汉方医学得到迅速发展，诞生了日本传统医学：汉方医学（或称东洋医学）。直到如今，古方派仍在汉方医学中占有主导地位。
从公元6世纪起，在这漫长的医学发展中，中国医学随着文化输出传至日本，日本的医学家们对中国医学倾注了极大的热情。到明治维新时期，长达一千二百多年，日本医学在系统学习和吸收中医学体系与方法中，不惜花极大的精力去研究揣摩，使其学术水平达到很高境界。无论是在理论方面，还是在临床应用方面，都展现出了极为深厚的功底和高深的造诣，使得中国医学在日本获得了极大的成就。并在医学思想与方法上直追中国历代医家，保持了与中国医学的一致性。体现在文献方面，《皇汉医学丛书》所收集的著作应当具有很大的代表性。
自《皇汉医学丛书》于1936年由香港陈存仁先生编撰刊行后，中央国医馆理事裘吉生先生原定于1937年8月出版《皇汉医学丛书续编》14册十八元，由世界书局发行，当时世界书局已经发行了正编，在宣传目录上推荐，凡购正编者，续编购买打七折，正续两编同购者亦七折。由于当时抗日战争的爆发，所以续编不见于世。
原刊凡例说，本编选辑，尤以适于实用为主，凡空洞之论，肤浅之谈，本虽不多，语或惊人，概不收入，期归实益，世有识者，当同情予言。
本编共分七十五种，医经六种、本草四种、针灸七种、伤寒金匮五种、内科十一种、外科四种、眼科一种、妇科二种、儿科四种、方书二十一种、杂著十种。其中日文原本者，皆请友好迻译校订。此等精妙学术，今之罕见，实为遗憾！
