控制科学与工程学院成立于2001年1月，其前身是创建于1946年的山东大学电机工程学系,后院系调整并入山东工业大学电机工程系。随着科学技术的不断进步，电机工程系各专业屡经调整，1989年改称自动化工程系。新山东大学成立后，更名为控制科学与工程学院。
目前，学院设有 4 个本科专业。专业设置跨工学门类中电气信息和仪器仪表两大学科，涵盖自动化、测控技术与仪器、生物医学工程和物流工程四个本科专业方向。其中生物医学工程和物流工程属新兴交叉学科，发展前景广阔。
学院拥有雄厚的师资力量，目前有教职工 148 人，其中博士生导师 18 人，教授 36 人，双聘院士 1 人，兼职教授 5 人，海外杰出学者客座教授 8 人。学院本科在校生 1500 余人，硕士、博士在校生 400 余人。学院已建立起学士 — 硕士 — 博士完整的人才培养体系，拥有控制理论与控制工程、检测技术与自动化装置、电力电子与电力传动和生物医学工程 4 个博士学位授予权，其中生物医学工程拥有一级学科博士学位授予权。学院拥有控制理论与控制工程、电力电子与电力传动、模式识别与智能系统、系统工程、检测技术与自动化装置、生物医学工程等 6 个工学硕士学位授予权。有控制工程、仪器仪表工程、生物医学工程 3 个工程硕士学位授予权和 1 个控制理论与控制工程教育硕士学位授予权。学院下设自动化、测控技术与仪器、生物医学工程和物流工程 4 个本科教学系和为本科教学服务的设备先进的学院计算中心和实验中心。学院下设自动控制、检测技术、系统工程、图象处理与模式识别四个研究所。还设有物流工程研究中心、控制论研究中心、机器人研究中心、高技术产业 — 山东山大奥太电气股份公司，集产、学、研功能于一体。
学院是南校区“ 211 工程 ” 五个重点建设单位之一，是 “ 十五 ” 强化建设省级重点学科单位之一。建有 “ 工业自动化 ”“ 控制理论与控制工程 ” 省级重点学科和 “ 工程系统控制 ” 省级重点实验室。近几年来我院教师承担国家重点攻关项目 10 余项，其他科研项目 100 余项，获国家级科技进步奖 4 项，省部级科技进步奖 30 余项；在国内外著名学术期刊上发表学术论文 1000 余篇。出版学术著作、教材 30 余部。
