1996年成立原湖南医科大学药学系，1997年面向全国招收四年制药学本科学生，2002年5月成立中南大学药学院。学院设有1办7系1室2所2中心（综合办公室；药理学系、药物化学系、药剂学系、药物分析学系、天然药物学系、临床药学系和药事管理学系；湖南省心血管研究重点实验室；中南大学药物研究所、计算机药物辅助设计研究室；药学实验教学中心和湖南省执业药师培训中心中南大学培训站。）学院有博士后流动站1个（药学），博士授权点1个（药理学，1981年批准），硕士授权点5个（药理学、药物化学、药剂学、药物分析学、生药学）。药理学为全国重点建设学科和全国精品课程，药学专业为湖南省普通高等学校重点专业。
药学院现有教职工51人，专任教师共有34位，其中正高职称8人，副高职称11人，博士生导师6人，国家级新药评审专家2人，省级新药评审专家5人；现聘中国工程院彭司勋院士为荣誉教授，聘有其他客座和兼职教授7人。
在校本科生240人，研究生128人（博士生29人，硕士生99人）。研究生获国家和省级奖励20余人次，包括全国优秀博士论文2篇，全国优秀博士论文提名奖1篇，全国三好学生1人。先后承担国家863项目，国家自然科学基金重点、面上和青年基金，教育部跨世纪人才培养计划基金，教育部重大项目，教育部优秀青年教师基金及重点跟踪资助，教育部博士点基金，湖南省自然科学基金，湖南省卫生厅重点项目等30余项纵向课题，以及60余项横向课题。在15种国际专业杂志发表科研论文140余篇（被SCI收录），获教育部、卫生部和湖南省科技成果奖19项。
