广东商人造船需禀报海关，给予红单以备稽查，故所造船名“红单船”。这种船体大坚实，行驶快速，每艘可安炮二三十门。后来，广东官员雇募它们用于海防。在太平天国时期，清政府把红单船武装调至长江流域镇压农民起义，起到了很大的破坏作用。
道光三十年（1850年）十二月，太平天国在广西桂平起义。咸丰二年（1852年）十二月，克武昌。钦差大臣向荣奏请调广东水师镇压太平军，清廷命他飞咨两广总督叶名琛等调拨应用。[1]（第4册，p314）
三年正月，太平军离武昌沿江东下。清廷谕两广总督叶名琛、广东巡抚柏贵：“现在赃匪东窜，江防万分吃紧，已命向荣驰赴江宁迎头截击。著叶名琛、柏贵即将该省外海水师拖古战船并快蟹、大扒等项凄足百只，多备子药，遴委水师勇干镇将大员统带，星速由海道驶抵江宁，听候该大臣拨用。”[1]（第4册，p543）
二月，太平军攻克南京，定为首都，改称天京。清廷谕叶名琛、柏贵迅即选派水陆精兵二三千名，并酌派大员管带，迅速前往江南，以助攻剿。[1]（第5册，p14）
三月，向荣奏请速催广东水师、上海火轮战船驶入长江会同陆路进攻。[1]（第5册，p438）
孙瑞珍奏请雇觅广东红单船赶江南向荣军营攻剿，称红单船俱出顺德之陈村等处，以贩油为业，往来吕宋、暹罗诸国，船只之快速，炮火之精锐，点发之娴熟，较之额设师船得力不啻数倍。所有舵工、水手皆父子兄弟，一遇敌皆合力向前，无推诿溃散之虞。船大者约计水手60余人，次亦四五十人或30余人。[1]（第6册，p148）清廷即谕叶名琛、柏贵迅将所雇红单船配带炮、药派黄开广带领速由海入江，听候向荣等调遣攻击。[1]（第6册，p207）又命叶名琛饬候补道伍崇曜雇觅火轮船只为攻剿太平军之用。伍崇曜，又名伍绍荣，原名元薇，字紫垣，广东南海人。其祖父伍国莹于1784年（乾隆四十九年）创设了广州十三行之一的怡和行。父伍秉鉴，以敦元为商名报册承充，行务大有起色，跃居十三行行首。因乳名亚浩，外国人呼为浩官。按当时行商子沿父名惯例，伍崇曜对外仍称伍浩官。[2]（p223）
当时，伍崇曜正卧病在床，得到通知后，即派亲信与英国代办领事官巴夏礼、英国公使文翰，美国副公使伯驾、公使马沙利等商雇外国兵船。因为密迪乐已在天京，与太平天国有两不相犯之约，故没有结果。叶名琛又命署顺德知县马映阶至陈村雇募红单船大号船8艘，中号船12艘，配足弁兵、炮械、火药、铅丸，由署香山协都司陈国泰管带，于五月二十一日起程，开往江南。并打算再雇多艘，由署海安营游击吴全美管带，陆续起程。所有船价、口粮并添配弁兵一切，即在部拨江南军需粤海关税项下动支。[1]（第7册，p194）
陈国泰，广东新安人，出身武生。[3]（卷一○）吴全美，字碧山，广东顺德人。[4]（卷四三）
六月二十一日，广东又雇得红单船大号6艘，中号8艘，除原船水勇照数应募不计外，每船加配水师各营弁兵帮同驾驶，共394名。又添配洋装大铁炮94尊，由一千数百斤至六七百斤不等。广东地方当局拨给火药五万斤[1]（第8册，p129），由吴全美统领起程开往江南。
八月，福建巡抚王懿德奏请将吴全美、陈国泰所率船队暂留厦门十五日，借以镇压该地民众的起义。[1]（第9册，p447）九月，王懿德又奏请使陈国泰带领第一批共20艘开往江南，吴全美所带14艘暂缓起程，继续镇压厦门的起义军。[1]（第10册，p202）十月，王懿德又奏称红单船多有损坏，须修补才能驾驶。清廷令王懿德饬红单船迅即开行，若须修理，亦著赶紧督办。[1]（第10册，p642）吴全美、陈国泰等于十月二十三日自厦门放洋，开往江南。[1]（第11册，p86）
十一月，署礼部左侍郎宋晋奏请特谕伍崇曜，迅再添募红单船百号。雇募之费，伍崇曜如能独力支付，助成巨功，固属至善，否则，前太常寺卿龙元僖家业亦优，可协办此事。令丁忧给事中苏廷魁督带，奋力清剿。咸丰帝接受了这项建议。[1]（第11册，p171）
吴全美等率船队由厦门开往福州修理，行至崇武外洋，陡遭风浪，船身损坏，遂开回广东修理。[1]（第12册，p126）
十二月，伍崇曜递禀帖给叶名琛、柏贵，说其父伍秉鉴承充洋商50余年，前后捐输银二百一十三万余两。鸦片战争之后，洋商裁撤，伍秉鉴旋亦病故。咸丰元年，他自己奉旨办理接济团练经费，伍氏家族共捐输银十万零七千九百四十九两。现在遵旨捐输雇觅红单船经费，谨捐银四万两，呈交广东藩库，作为红单船经费，不敢仰邀甄叙。[5]
咸丰四年二月二十九日，叶名琛派红单船50艘由广东放洋，再次开往江南。
六月初六日，吴全美等抵吴淞口，上海有截留之意，清廷谕两江总督怡良、江苏巡抚吉尔杭阿，命红单船入江与艇师合队。二十二日，行抵镇江焦山，因风逆未能即上。七月初二日，至瓜洲以西，江北大营钦差大臣琦善召吴全美到营，面授机宜。[6]（卷七）吴全美、陈国泰进攻瓜洲，为红单船与太平军之首次作战。吴全美部被向荣调赴上游，陈国泰部泊瓜洲大口以上。[7]（卷九八）
闰七月，吴全美等与燕王秦日纲战于天京三山营江面，俘太平军大小船260余艘，士兵200余人。[1]（第15册，p178）接着，又与顶天侯张显作战，击毁太平军船一二百艘，俘去数十艘，张显等100余人被俘。[1]（第15册，p223）
在扬州，陈国泰督饬千总赖镇海等夜袭瓜洲，未能得手。[1]（第15册，p259）赖镇海，字盘洲，东莞县昌平洲人，行伍出身。[5]（卷七二）
在太平县，吴全美击毁太平军船百余艘，俘太平军30余人。[6]（第7册，p343）
八月，吴全美等在浦口截击太平军运粮船队，击沉太平军船十数艘，总制谭龙才等被俘。[1]（第15册，p558）
向荣对吴全美大加奖赏。扬州大营单衔檄调，吴全美不禀请向荣示遵，即带船折回浦口。向荣认为吴全美意存退缩，上奏清廷，表示极大不满。[6]（第7册，p357）
九月，太平军运粮船队由天京下关出发下驶，吴全美等再次截击，前后三日内，击毁太平军大小船30余艘。[6]（第7册，p374）
十月，陈国泰等截击太平军船簰于泗源沟、李家沟，俘船簰2艘，得铜、铁炮18尊，白米、黄豆900余石，春官正丞相黄起芳等阵亡。[1]（第16册，p57）
吴全美等攻毁九洑洲太平军营盘。[1]（第16册，p78）
十一月，清廷寄谕托明阿、向荣等，命吴全美即率水师上驰芜湖会剿。[1]（第1册，p171）
向荣因吴全美与叶常春意见不合，互相猜疑，令副将李德麟与叶常春彼此对调，以便与吴全美会合上攻。[6]（第8册，p402）
十二月，吴全美等在下关江面击沉太平军大船2艘，小船十数只。红单船也被打穿几艘。[6]（第8册，p409）
五年正月，吴全美等在下关击沉太平军船7艘，红单船亦被击损7艘。[1]（第17册，p64）
二月，吴全美等又在七里洲与太平军作战，烧毁买卖街。烧毁船排三排。[1]（第17册，p153）
三月，升任总兵的吴全美等在下关一带与太平军鏖战多时，斩断拦江铁索2道，击沉、焚毁太平军船三百数十艘。[6]（第8册，p447）红单船被击沉1艘、击伤多艘。红单船队上驶。至三山营一带，连日与太平军作战，击沉太平军船数十艘，烧船厂1座。吴全美对向荣表示，红单船每年须修艌一二次，自上年春天由粤驶来，年余未经油艌，船身多为大炮震裂，恐日久渗漏，且仅止40余艘，为数较少，不可不早筹办。向荣奏称上年广东续调之拖古船30余艘，红单船20艘，派令碣石镇总兵谢焜统带，早经奏报起程，迄今未到，请督催赶紧来江助剿。[6]（第8册，p460）
吴全美等再与太平军战于三山江面，焚毁太平军船200余艘，夺获25艘，炮85门，火药4000余斤，炮弹3000余发。先锋陈长顺等被俘杀。红单船被击沉1艘。经向荣奏准，将吴全美、李德麟交部从优议叙。[6]（第8册，p466）
四月，吴全美等又在上三山与太平军作战，烧沉太平军船不下200艘，夺获16艘，得谷米40余石、大炮1门，攻陷炮台3座。[6]（第8册，p473）
吴全美等配合翼长总兵德安指挥之陆军与太平军作战于三山，焚破太平军营垒3座，毁炮台7座、军卡10余处，击沉船七八十艘，夺获船22艘、大小炮35门。太平军阵亡二三千人，遂退往大胜关。[6]（第8册，p482）
吴全美探知铜井太平军扎造木簰，堆集芦柴引火之物，遂派40余艘战船至铜井，将木簰7只及芦柴尽行焚毁。
五月，在上河口江面击沉太平军船6艘。焚毁木焜5只，烧大粮船2艘，夺获1艘。[6]（第8册，p488）
太平军划船数十艘、大船20艘由天京运粮下驶至浦口，总兵叶常春令赖镇海等截击，划船被击沉数艘、烧毁多艘，毁大船3艘、击沉2艘、夺获1艘。[1]（第17册，p396）
六月，吴全美、李德麟所部配合陆军明安泰、德安等部，连日与太平军作战，击沉太平军船数百艘，攻陷太平县及芜湖，太平军阵亡1万余人。[1]（第17册，p403，p440）
七月，水师总兵陈国泰配合托明阿部等陆军进攻瓜洲。守备赖镇海等在下关击沉太平军船多艘、夺获3艘，得米粮30余石，获大炮4尊。[1]（第17册，p477）
八月，吴全美部配合其他清军攻破芜湖外援太平军营垒11座，击沉太平军船20余艘，夺获米、豆、弹药、火器船11艘，太平军阵亡1000余人。[6]（第8册，p497）
九月，攻破弋矶、广福矶太平军营垒7座。[6]（第8册，p497）
又连日与太平军作战，攻破营垒多座。
李德麟等在荻港击沉太平军船十数艘，夺获4艘。指挥黄心田等被俘杀。[6]（第8册，p511）
金门镇总兵陈国泰助江苏巡抚吉尔杭阿进攻镇江。[6]（第8册，p518）
十月，太平军自安庆增援芜湖，被吴全美等击沉船10余艘，夺去大木簰1只、大粮船1艘、稻谷200余石、枪炮等20余件。[1]（第17册，p640）此役太平军的将领为检点赖桂英。
吴全美还指挥把总郭定猷等炮毁柳林太平军米粮、火药仓库1所，拦江夺获小划7只、大竹簰1只。总制廖述祖被俘杀。
李德麟在繁昌旧县江面击沉太平军船10余艘，夺获2艘。[6]（第8册，p526）
十一月，吴全美派把总郭定猷拦江，在芜湖江面击沉太平军船2艘，夺获1艘，太平天国承宣邱广升阵亡。[6]（第8册，p529）
陈国泰在镇江江面夺获太平军木筏1只、焚毁1只，并夺获江船多艘。吉尔杭阿认为陈国泰此仗代价甚小，赏银四百两。[6]（第8册，p543）
李德麟带领红单船在芜湖神塘河击沉太平军船30余艘，检点赵元发等被俘杀。
吴全美在裕溪口击沉太平军运粮船2艘。
十二月，吴全美、李德麟在荻港击毁太平军船数十艘，将军王纪兴等被俘杀。又在刘家渡江面夺太平军船30艘、军器200余件。[6]（第8册，p554）
叶名琛奏报，又雇得红单船37艘，派参将李新明带队从广东出发，开往江南。[6]（第8册，p570）
在这一年，由于东莞县绅士捐输红单船经费，清政府决定将东莞县科举考试的学额永远加两个名额，以示鼓励。[5]（卷三五）可见雇用红单船的经费并非由清政府支出，也不仅是由伍崇曜捐输，同时还有广东各县绅士的捐输。
咸丰六年正月，吴全美部在东、西梁山江面击沉太平军船数艘，焚毁运粮船十余艘，夺获2艘。二月，又在裕溪口、四合洲及东、西梁山等处与太平军作战，攻击太平军营垒[1]（第18册，p153）
陈国泰等在镇江江面击沉太平军划船10余只。[1]（第18册，p165）
吴全美、李德麟等又在大通江面击沉太平军船20余艘，夺获10余艘。[6]（第8册，p593）
三月，燕王秦日纲等克扬州。清廷将托明阿等革职查办，以正白旗汉军副都统德兴阿为钦差大臣，詹事府少詹事翁同书帮办军务。秦日纲部西进，德兴阿等陷扬州。
吴全美部在裕溪口击沉太平军船5艘，将军陈玉金等被俘杀。[6]（第8册，p611）
广东续雇之红单船27艘，由游击李新明、都司黄彬带领先后驶抵焦山。[6]（第8册，p615）黄彬，广东顺德人，行伍出身。[4]（卷一○）
四月，秦日纲等败清军于镇江烟墩山，江苏巡抚吉尔杭阿死亡。
太平军克芜湖。吴全美部连日与太平军作战之后，奉命撤至江宁镇一带。[6]（第8册，p617）
五月，翼王石达开、燕王秦日纲等率军大破江南大营。向荣等退往丹阳。
六月，参将李新明在六合东沟一带击沉太平军船多艘，太平军阵亡100余人。[1]（第18册，p533）
七月，向荣死于丹阳。
八月，因东王杨秀清逼天王洪秀全封他为万岁，洪秀全命北王韦昌辉、燕王秦日纲率部将杨秀清等杀死。
清廷以江南提督和春为钦差大臣，督办江南军务。
陈国泰、黄彬等配合陆军进攻瓜洲，击沉太平军船数艘，攻陷炮台数座。[1]（第18册，p633）
李新明等在六合东沟江面夺获太平军船2艘，击毁岸上土垒2座。[1]（第18册，p635）
十月，洪秀全应众多将士的要求，将韦昌辉杀死。迎石达开回京辅政。
安徽巡抚福济奏称克复和州，驰援桐城，李德麟部仅有红单船、快蟹船14艘，上下游不能兼顾。吴全美部红单船40余艘停泊芜湖鲁港，请饬红单船协剿。清廷命和春、德兴阿即饬吴全美部听候福济调遣。[1]（第19册，p14）
太平军大木排4架，中裹船只，随大小船数十艘渡江围攻土桥水营，被陈国泰打退。[1]（第19册，p72）
十一月，湖北巡抚胡林翼等陷武汉。
陈国泰派兵登岸助攻瓜洲，夺获大炮2尊、火枪4杆，太平军阵亡百余人。[1]（第19册，p99）
十二月，叶常春等在天京七里洲江面击沉太平军船数艘，焚毁六七艘，夺获船2艘、大炮4尊，药弹数百斤。[1]（第19册，p115）
陈国泰、赖镇海等配合陆军进攻瓜洲。[1]（第19册，p121）
吴全美等在芜湖江面进攻太平军运草船、岸上石垒，垒内火药延烧，军械焚毁一空，太平军死伤不计其数。
咸丰七年正月，吴全美指挥郭定猷等击沉太平军船10余艘，夺获6艘，攻陷双港，太平军阵亡四五百人。[1]（第19册，p184）
二月至四月，陈国泰等配合陆军进攻瓜洲。[1]（第19册，p245，p326，p354）
叶常春等在七里洲江面击沉太平军船十数艘，夺获一艘。攻破九洑洲太平军营垒4座。[1]（第19册，p356）
五月，翼王石达开因天王洪秀全猜忌率所部十万余众离开天京。
陈国泰部红单船户捐造火船20艘，向瓜洲大口突入焚烧，从高资来的太平军米船13艘被烧毁，检点覃沅发被烧死。太平军阵亡300余人。李新明等在石埠桥登岸，烧太平军营卡数处，太平军阵亡数十人。[1]（第19册，p435）
闰五月，李新明等在石埠桥南岸与太平军作战，太平军阵亡数十人。[1]（第19册，p480）
六月，吴全美部在芜湖泥汊焚毁太平军大簰数座，击沉炮划数只，夺获炮划4只，太平军阵亡百余人。
七月，吴部击沉炮划甚多，夺获十余只，太平军阵亡四五百人。检点张大来等被俘杀。[1]（第19册，p560）
守备赖镇海等配合张国梁部陆军进攻高资、鲇鱼套，轰倒炮台数座，击沉炮划数只。[1]（第19册，p553）
陈国泰等在瓜洲击毁太平军大粮船1艘。八月，又击沉小船2艘。[1]（第19册，p592）
九月，参将黄彬等在浦口观音门和天京下关、九洑洲、七里洲江面屡与太平军作战，击沉大楼船数艘、大炮船1艘、船划数只，夺船2艘。
十月，赖镇海等继续攻击鲇鱼套太平军。[1]（第19册，p683）
湖广总督官文、湖北巡抚胡林翼奏称湘军水师杨载福等部转战1000余里，克复县城3座，破垒数十座，至铜陵旧县峡口面见李德麟。李德麟攻7月之久、悬赏一万六千金也未能攻破之泥汊，被杨载福一举攻克。“红单船向称勇悍难驯，统带之员每难调遣。此次目击杨载福奋勇冠军，士卒用命，虽桀骜性成，亦为心折，将来大军整旅东征，必能和衷共济，尤为军营紧要关键”[1]（第20册，p25）
十一月，陈国泰等配合陆军攻陷瓜洲，击沉太平军大船数艘、划船多只，夺船30余艘、大炮26尊、炮子40余石、火药20余石。[1]（第20册，p54）
黄彬等击沉太平军船2艘，夺获2艘，得米20余石、炮2尊、火药300余斤、炮弹500余斤。攻破燕子矶营垒一座，将领陈恩书阵亡。
李新明等夺获划船4只、火药200余斤、炮弹340颗、大炮3尊、抬炮42尊、米十余石，攻破石埠桥营垒1座。[1]（第20册，p66）
赖镇海等焚毁太平军船数艘，夺获大船4艘、划船8只、铜炮18尊，攻破鲇鱼套营垒多座。[1]（第20册，p73）
十二月，陈国泰等进攻七里洲、下关、九洑洲一带，击毁太平军营卡、望楼数处，太平军伤亡甚多。[1]（第20册，p119）
都司赖镇海等在七里洲江面击沉太平军木簰2只、船数艘，太平军阵亡数百人。[1]（第20册，p142）
咸丰八年正月，陈国泰、赖镇海等在七里洲、下关江面击沉太平军船数艘，太平军阵亡者为数不少。[1]（第20册，p159）
三月，游击赖镇海配合陆军在天京上关、双闸口、下关等处与太平军作战，击沉太平军船数艘，击毁太平军营卡、望楼多处。[1]（第20册，p259）
五月，官文奏称九江克复，杨载福可直达安庆，会合芜湖红单船并力东征，“闻红单炮船诚属利器，足以制敌，其将弁中必多好手。惟船身笨重，不如长龙、舢板进退攻击风帆便捷。其水勇闻亦性情难驯，应请密饬带兵大员与杨载福和衷共济，合为一体，相机妥办”[1]（第20册，p397）。
和春奏称李德麟部在二三月间于铜陵江面击沉太平军船50余艘、夺获15艘，攻陷繁昌。四月间，又攻陷太平军土桥营垒，太平军阵亡一千六七百人。五月，太平军进攻鲁港，被吴全美部击败。[1]（第20册，p394）
李德麟部攻陷太平军神塘河营垒，太平军阵亡六七百人。李部获炮11尊，火箭、喷筒200余枝，子药3000余斤，米40余石。[1]（第20册，p403）
赖镇海等在下关江面夺获太平军船1艘，炮械多件。
六月，赖部又夺获船1艘，太平军阵亡百余人。[1]（第20册，p443）
浙江温州镇总兵吴全美和杨载福一起至芜湖察看形势。[1]（第20册，p455）
赖镇海等在双闸口、金柱关、寿德洲江面击沉太平军船6艘，夺获20余艘。
七月，赖镇海等配合陆军进攻临江、新城太平军营垒。[1]（第20册，P466）
陈国泰、黄彬、李新明等击沉太平军船十余艘，夺获划船4只，击毁九洑洲营垒多处。[1]（第20册，p489）
八月，前军主将陈玉成、后军主将李秀成等再破钦差大臣德兴阿大营，德兴阿退走扬州。
太平军进攻陈国泰水营，船被击沉数只，退去。[1]（第20册，p585）
九月，李秀成克扬州。不久被张国梁夺去。
十月，吴全美部在芜湖击沉太平军船十余艘，焚毁更楼3座、营卡2座、峨桥营垒1座。[1]（第21册，p74）
英国公使额尔金带5艘轮船至天京下关，红单船摆开阵势，呈与轮船会攻太平军态势。太平军开炮轰击轮船，轮船还击，约一时许，轮船齐泊上关。次日，又回下关，与红单船一起轰击太平军营垒，约两时许。太平军未还击。英国轮船驶往上游而去。[8]（卷三三）
十一月，吴全美部与陆军配合在芜湖鲁港一带攻陷太平军营垒多处。[1]（第21册，p105）
十二月，李德麟部在桐城六百尺江面击沉太平军船20余艘。
咸丰九年正月，吴全美部在芜湖江面夺获太平军船3艘，太平军阵亡百余人。[1]（第21册，p148）
镇守江浦的答天豫薛之元降清，太平军出师讨伐。和春派赖镇海救援解围，李昭寿入城受降。[9]（p423）
二月，钦差大臣、蒙古都统德兴阿被革职。江北军务由和春节制，以宁古塔副都统富明阿帮办军务。
五月，浙江定海镇总兵李德麟部在无为泥口击沉太平军划船20余只，夺获7只。攻破毛坦等处太平军营垒多座，太平军阵亡四五百人，损失弹药500余斤，米麦40余石。
吴全美部在陈家洲与太平军作战[1]（第21册，p405），击沉太平军划船4只。红单船5艘被击损。[1]（第21册，p422）
六月，吴全美部在鲁港击沉太平军划船2只。
七月，赖镇海等在三山、乌江一带击沉、夺获太平军船多艘，获米粮一千数百石。陈国泰部在浦口击毁太平军卡楼数座。[1]（第21册，p480）吴全美等在三山江面击沉太平军船10余艘，夺获3艘。
八月，赖镇海等在和州江面夺获太平军船4艘、稻谷200余石、盐40余石。[1]（第21册，p531）
九月，吴全美部攻破芜湖横山、峨桥等地的太平军营垒。[1]（第21册，p586）李德麟部在大通江面击沉太平军船10余艘，夺获3艘，炮3尊。信天福钟廷才等被俘杀。[1]（第21册，p633）
十月，水师游击赖镇海等在东西梁山击沉太平军船10艘，毁兵卡1座。[1]（第21册，p643）
李德麟部接应韦志俊在池州叛变。[1]（第21册，p678）
十一月，水师游击郭定猷等在和州攻破太平军营卡两座。十二月，又在金柱关击沉太平军船多艘，夺获16艘。[1]（第22册，p6）
咸丰十年正月，陈国泰、黄彬、赖镇海、郭定猷、李新明等配合陆军攻陷九洑洲。太平军阵亡1000余人，损失大炮数十尊。[1]（第22册，p10）清廷赏给黄彬、赖镇海、郭定猷勇号，李新明升副将，加总兵衔。[1]（第22册，p16）天京再次被围困。洪秀全召上游太平军来救。
二月，陈国泰等配合陆军攻陷上关、下关营垒多座，夺获船六七十艘，大炮一百数十尊，秦礼国等太平军降者5000余人。[1]（（第22册，p40）
闰三月，忠王李秀成、英王陈玉成等大破江南大营，张国梁死于丹阳。
吴全美率部破芜湖对岸营垒，守将陈芸桂投降。
四月，和春死于无锡。
清廷命荆州将军都兴阿督办江北军务；命福建提督李若珠严防江面，勿使太平军北渡；又以曾国藩署两江总督。
李若珠奏准将吴全美部船200余艘调驻狼山、福山。
陈国泰等在东沟击沉太平军船3艘，夺获快划3只、大炮2尊。[1]（第22册，p334）
倪在田记载：“水师呼饷不复应，终岁才得四月食，乃自立厘卡食其军……部将郭定猷、李新明先与贼目相酬应（皆东粤产，又只一江隔之）……冒私贩物，远至九江、湖北，近饷金陵之贼。”[6]（第5册，p131）
七月，清廷加给黄彬提督衔，命他统带镇江、扬州一带水师船队。
九月，赖镇海、李新明等在丹徒江面夺获太平军船80余艘、粮米3000余斤、火药460余斤、铅弹1700余发。[1]（第22册，p547）
黄彬、郭定猷部与团练陷江阴。
十二月，清廷命黄彬帮办都兴阿江北军务。
咸丰十一年正月，都兴阿奏称：“其水师正饷，本由江南粮台支应，吴全美、李德麟勇粮各项归江北粮台动支。”[7]（卷二五八）
三月，都兴阿奏称：镇江、扬州之红单船、拖罾船均由广东调来，近多损坏，修复无款可筹，请饬两广总督迅调红单船等40艘至长江。清廷谕劳崇光办理。[7]（卷二六一）
六月，清廷以吴全美统领镇江至江阴一带水师。[7]（卷二六七）
八月，曾国荃陷安庆。
同治元年（1862年）二月，冯子材等奏准由广东每月添拨水师饷银二万两。[7]（卷二九四）
三月，李鸿章率淮军抵上海，署江苏巡抚。
曾国藩奏准在韶关收取厘金以济湘军军饷，“并抵广东省应解红单艇船经费”[7]（卷二九八）。
四月，劳崇光复奏，已派守备李荣升、黄联开赴各港口招集红单船10余艘，招募壮勇，在三月以内可募足40艘，配足炮械、米粮后放洋。[7]（卷二九九）
五月，湘军水师配合曾国荃部进逼天京。
广东巡抚耆龄奏奉旨赴闽援浙，雇募红单船10艘，购洋炮86尊，募水勇配驾。[7]（卷三○五）
六月，李鸿章在给曾国藩的信中写道：“红单水师各将，惟吴全美尚能打仗，黄彬贪劣，李德麟骚扰，皆与冯日坤相等。”[10]（卷一）
七月，李鸿章在给曾国藩的信中又说：“至续调红单四十船，都公为黄彬所而奏请者，乔都转及南、北台、镇江金守皆有密函求鸿章咨商截止，此岂一咨所能允从，俗借大力去后日无穷之患，但使新船不来，现各部旧船俱朽坏不能动，勇数亦虚，翦除尚易。”[10]（卷一）
李鸿章又奏称：“上年都兴阿、黄彬请调广东红单船四十号，所需饷项，现实无款可筹。查水师各帮内原雇红单船七十七只，兼之大洋舰、快蟹、拖罾各项战船，共三百余号，目下纵有抽减，如以船身稍旧者碇泊驻防，以其坚固者出江堵击，似尚足敷调拨。应请饬令都兴阿、黄彬及广东督抚臣将前调红单等船四十号即行停止，如已报起程，无论驶至何处，即令折回，毋庸来江，以节糜费。”于是，清廷发出上谕：“红单水勇多系粤省亡命之徒，与粤匪难免熟悉勾通，前此江南用之，有害无利，当此军情得手，大局已有转机……都兴阿……著查看情形，如前次奏调红单等船四十号可以毋须来江，即著迅速奏请停止，一面行文广东督抚截追回粤。”[7]（卷三一五）
劳崇光雇募之红单船36艘放洋开往扬州。
八月，劳崇光奏称：遵旨雇红单战船四十号，派游击黄联开等管带，风毁四号，配以炮火器械、官弁三十六员，柁工、炮手、水勇一千六百五十六名，于七月二十五日起碇赴都兴阿军营。于是，清廷又发上谕：既经驶入长江，无再令折回之理，命黄彬严加约束，如不得力，酌情撤回。[7]（卷三一九）
李鸿章复信给乔松年道：“水师弁勇贩卖米、药济贼，中外共闻，该管镇将如肯实力谕禁，即不能御贼，或不至勾贼也。新调红单船四十号，昨准都帅咨复，业准停调……似都公尚有意整顿，未尽为人蒙蔽。李新明、沈振廷声名极坏……吾丈能否为都帅密陈汰遣以除民害而儆其余，如沪将冯日坤通贼扰民……密旨饬……传旨正法……业已遵照惩办。……吴碧珊移防通海下游，亦较得力。”[10]（卷一）
李鸿章在给曾国藩的信中又写道：“黄彬实非善类，都公始为护庇，近缘廷旨饬查，似稍觉察，然未能去之。乔都转续函谓若将下游水师总统奏归杨军门，则水营必易整饬。”[10]（卷一）
都兴阿奏称：各帮大小炮船仅二百八十六只，上自浦口，下至狼、福山，分防六百余里。拟停调广东师船，在湖北造船募勇。清廷上谕：广东红单船三十六艘，势难再令折回。[7]（卷三一九）
闰八月，卞宝第奏参红单船各将，称：帮办军务水师总统黄彬安坐瓜洲，不理营务，收取厘金，侵吞肥己。上年六月，游击郭定猷掳劫商船，杀数百人，得数十万，擅禀战胜，奏请奖励。总兵李德麟在通州城外占住民房，纵情声色。总兵陈国泰、赖镇海，游击张瀚皆有通贼之事。吴全美战阵虽勇，然赋性贪猾，纪律不严，不宜专防之事。清廷发上谕：命曾国藩、李鸿章查办。[7]（卷三二二）
九月，红单船36艘到上海，李鸿章截之使回，不听，径赴都兴阿、黄彬两处。李鸿章认为“黄彬欲添羽翼，岂肯放回”[10]（卷二）。游击黄联开带勇字船18艘、都司李荣升带仁字船18艘共36艘在都兴阿处报到。[7]（卷三二六）
十月，漕运总督吴棠、署道赵炳麟、粮台乔松年、淮扬水师统领黄昌歧皆向李鸿章推荐吴全美取代黄彬。吴全美也写信给李鸿章，说红单船虚糜月饷，无裨实用，应加以整顿；都兴阿改造长龙、炮划，捕杀都司刘大彰，皆黄主谋。李鸿章向曾国藩表示：“暂留粤船即不得不用粤人。”[10]（卷二）
十一月，李鸿章奏参黄彬专以设卡网利为事，又拦劫商民，焚毁村庄，掳杀难民，捏报胜仗。广勇犷悍，非粤人不能驾驭，请将黄彬革职，令吴全美接统师船，仍归曾国藩、都兴阿节制。应将旧船裁撤。沿江厘金，可派员稽收，均匀摊放，不准泊防师船分段把持，任意提用。于是，清廷将黄彬革职，交曾国藩查办，由吴全美统领水师。[7]（卷三二七）
同治二年正月，都兴阿奏称各帮师船亟应裁撤，而欠饷甚多，红单船船价、勇粮有欠至二十余月、三十余月者，既裁撤，必应补给，旧欠应由粮台造册，咨交两广总督补发，并先由江苏巡抚筹给一月口粮作为盘缠回粤。拟派参将李新明督同广东师船回粤。请派总兵陈国泰统带回粤。清廷准行。[7]（卷三三二）
三月，护王陈坤书率部自天京七里洲北渡，被吴全美等所败。
四月，李鸿章在给曾国藩的信中写道：“奉旨饬查大江水师一案……缘吴全美接统后江面渐觉肃静，郭定猷、张瀚等现仍分防，未便追究既往。陈国泰所部济贼多年，兹已遣撤回粤，应予薄惩。泊镇年老勒休，似亦可塞众望。江防吃重之时，无船可替，既用其人，不得不量从末减。且水师借口饷缺，营规实难深求。”[10]（卷三）
五月，湘军水师陷九洑洲，守军2万人阵亡。
八月，都兴阿、富明阿奏称：“总兵吴全美自军兴以来，久带水师，转战江南、江北，叠著战功，营规整肃，大小将弁，无不畏服……联络调度一切均合机宜。”[7]（卷三五）
九月，曾国藩奏称：“本年三月，有人见黄彬在船宴客，闻即粤逆渠魁。五月内石埠桥甫经投诚之贼在仪征县杨钟琛公寓宴饮，门外拥进多人，询系黄彬水勇来寻贼目索取米账。并有接济贼米之船经民团查获，该镇辄借词抢案惩办民团。”[11]（卷一九）
同治三年四月，清廷调都兴阿为西安将军，以富明阿为江宁将军。富明阿奏称：“江防各帮师船随征十余年，身经百余战，巡防堵截，力保完善……师船一律议裁，似与凯旋无异，可否由臣择尤请奖以示鼓励之处，出自鸿慈。”清廷命“著照所议办理”[7]（卷三七四）。五月，以吴全美为福建水师提督。
六月，曾国荃攻陷天京，太平天国政权结束。
七月，富明阿奏称：金陵克复，红单船二十五只，作为头批，令提督赖镇海管带回粤。二批派副将林宜华管带回粤。三批统由提督吴全美统带回粤。[7]（卷三八五）
八月，富明阿奏称：吴全美禀：红单船自咸丰三四年间先后奉调出师，由粤而闽而江，十有余年，转战三省，兹幸金陵克复，各船遣散，官弁兵勇，共庆生还，而追念死事诸人，未忍听其湮没，拟捐资在广东顺德建立忠义祠，历年伤亡官兵均准入祀。清廷同意。[7]（卷三九○）
十二月，清廷因徐宗干奏请，命福建水师提督吴全美迅速赴任。[7]（卷三九九）吴全美请假三个月回籍修墓。清廷准许。[7]（卷四○○）
同治四年四月，闽浙总督左宗棠命吴全美速带所雇红单船20艘、拖罾船20艘驶赴铜山，阻截侍王李世贤部出海。[7]（卷四○四）闰五月，李世贤部失败，左宗棠派吴全美部巡海。[12]（卷一四）五年五月，吴全美因病开缺。[12]（卷一七）光绪八年（1882年），吴全美督建鹅颈炮台，命名定洋。又修复沙角炮台，抵抗法国侵略。[5]（卷二八）吴病死于光绪十一年。
综上所述，可见红单船是广东民间经营对外贸易的大货船，为了对付海盗的侵袭，装备有火力强大的枪炮。在太平天国时期，清政府雇佣这些船只，配备水师军官以镇压农民起义，经费由广东省筹措，基本上由各县绅士捐输。红单船武装先后在福建、江苏、安徽等省与农民起义军作战，击毁太平军船只以千计，杀伤太平军以万计，夺获军火、粮食等物资数量惊人，给太平天国带来了严重的伤害。由于其月饷不能及时供给，于是私设关卡，抽收厘金自给，进而与太平军贸易自肥。又抢劫商旅，杀害民众，虚报战功以求封赏。终于为人揭发，被陆续裁撤。红单船问题是太平天国史上很值得研究的课题。
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