长春足球的历史并不短，计划经济年代的长春足球队是一支乙级队，于1988年正式解散。虽然处于低级别联赛，但依然为国家队输送了姜峰这样的优秀人才。
1994年职业化足球在中国刚刚诞生，就在长春这块土地上长出嫩芽，经过两年的酝酿，长春亚泰足球俱乐部于1996年6月6日正式挂牌成立，俱乐部注册资金1000万元，是由吉林亚泰(集团)股份有限公司投资创建的一家职业化足球俱乐部。俱乐部的第一任主教练是辽宁非常有名的老教练李旭川，董事长为亚泰集团有限公司总裁宋尚龙，顾问为原中国足协主席年维泗。
俱乐部成立之初得到了省、市领导的广泛重视，中共吉林省委常委、长春市市委书记米凤君亲自过问，长春市副市长安莉经常深入俱乐部探望，原吉林省体委和长春市体委的领导也给予了大力支持。
俱乐部一线队1997年正式参加全国足球乙级联赛。在1997－1999年连续三次冲击甲B未果后，2000年亚泰俱乐部与八一超能兵合一处，组成长春亚泰雄狮队征战2000年甲B联赛，结果初出茅庐的长春亚泰队竟取得了第五名的佳绩。
2005年7月，国奥教练组集体转会到长春亚泰，他们带着曹明、杜震宇这些昔日弟子们，打着361的旗帜，带着国奥的烙印，最终实现了“魔鬼回归”，提前完成了冲超的使命。
亚泰历史：
1996年6月6日，长春亚泰足球俱乐部正式挂牌成立。
1997－1999年间，长春亚泰三次参加乙级联赛，其中两度杀入八强，但总是在最后时刻功亏一篑，未能冲甲成功。
2000年，亚泰俱乐部与八一超能兵合一处，组成长春亚泰雄狮队征战2000年甲B联赛，结果初出茅庐的长春亚泰队竟取得了第五名的佳绩。随后长春亚泰俱乐部最终决定出资1500万元永久买断八一超能的甲B参赛权，自此长春亚泰成为了一支真正的职业球队。
2001年，长春亚泰足球队以1个净胜球的优势力压成都五牛队获得甲B联赛第2名。但中国足协最终认定其参与了打假球，不仅取消了其升级名额，还对相应教练、队员给予了处罚。
2002年、2003两年中，长春亚泰在甲B联赛中的成绩不错，2003年甚至以领先第二名河南建业5分的巨大优势获得冠军。但按中国足协的计划，这两年都是调整年，暂停升降级。
2004年的中甲联赛倒是有两个升级名额，但这一年国奥队打预选赛抽调了多名亚泰主力球员，使亚泰实力受到相当大的影响，积分也因此被拉开了巨大差距。虽然他们后一阶段奋起直追，但已经无法超越武汉和中邦两队，再次抱憾而归。
2005年7月，国奥教练组集体转会到长春亚泰，他们带着曹明、杜震宇这些昔日弟子们，打着361的旗帜，带着国奥的烙印，最终实现了“魔鬼回归”，提前完成了冲超的使命。
主要获奖名称：
2001年全国足球甲B联赛第2名
2003年全国足球甲B联赛第1名
2005年中甲联赛第2名
2006年中超联赛第4名
2007年中超联赛冠军
并且获得了参加2008年亚洲冠军联赛的资格
在2008年亚洲冠军联赛的比赛中2：1战胜了越南平阳，客场在少3名国脚的前提下0：0战平澳大利亚阿德莱德
占据了出线的有利位置
2009年中超联赛亚军
