冯肇宪，广东番禺人，1913年冬毕业于广东黄埔水师学堂第十届驾驶班。毕业后，冯肇宪一直在广东海军服役，但因广东海军很稳定，使他在前途并不乐观的情况下逐渐倾向革命。
1919年，粤军决定回师讨桂，孙中山派孙科到澳门以特派员名义成立办事处，策动在粤海陆军起义。冯肇宪被任命为策动海军起义的督察长，参加第三小组行动，负责夺取江固号炮舰。7月15日，冯肇宪等已联络好江固舰上的内应，准备午夜夺舰。但是晚10时许，获悉此次行动计划的一批绿林中人提前将舰自省河东堤劫走，冯肇宪等人以为计划暴露，只好取消行动。此次夺舰虽未成功，但冯肇宪却由此与孙科在广东海军中的亲信陈策建立了密切的联系，进而得到孙科的信任。
1922年4月27日，孙中山下令以武力改组由闽籍军官把持的护法舰队，派广东水鱼雷局局长温树德和长洲要塞司令陈策分别率改死队夺取名舰。冯肇宪随陈策负责夺取驻省河的永丰等浅水炮舰，并发挥了重要作用。夺舰成功后，冯肇宪因功，于4月30日被孙中山任命为永丰舰舰长。作为该舰的第五任舰长，他的年龄比前四任舰长都要小，资历也浅得多。冯肇宪能够跃升为永丰舰长，主要靠的是他与陈策的关系以及他对孙中山的忠诚，而他的忠诚很快又得到了进一步的证明。同年6月16日，陈炯明变，派兵围攻孙中山的住所。孙中山脱险后登上楚豫号炮舰，次日又转登永丰舰，并以此为座舰，在该舰平叛待援长达54天。在这段时间里，舰长冯肇宪率领全舰官兵以对孙中山的忠诚和拥护，坚决执行孙中山的一切命令，并确保其生命安全，表现非常出色。当孙中山于8月9日离开永丰舰转道香港赴上海时，冯肇宪认为既然军舰不能随先生行动，自己留在舰上已无意义，因此也毅然离舰，追随孙中山继续革命。唯冯肇宪此后的经历，未见有资料记载。
