现在对深部生物圈还没有严格的定义，但是它已经成为生命起源与进化、地球系统进化和演化、全球变化和海洋生物技术开发利用的研究热点。
从众多的文献资料与新闻报道中，我们不难总结出其含义：在深海钻探计划（Deep Sea Drilling Project，DSDP）和大洋钻探计划（Ocean Drilling Program，ODP）的实施过程中，科学家们发现海洋底部及海底地层800米以下均有微生物活动的迹象，他们把这个区域称为海洋深部生物圈，当然这个生物圈里的生物主要是微生物，它们的储量、分子多样性，以及生理生态功能都十分丰富多样。