杨凌新火车站于2006年8月1日落成启用。新火车站位于杨凌示范区西宝中线路北，陇海铁路南侧，其东西长109.52m,南北宽70.92m,充分体现了"突出特色，以人为本"的建设理念，客运设施实用，先进，整体线条简洁，流畅，外观设计极具现代气息，表达了"扬帆远航"的深刻寓意，是一座外观新颖，功能齐全，设施完善的景观工程。该站站舍结构类型主体为框架，部分为转混，建筑面积2659平方米，建筑高度19.45m。主建筑采用透亮点支玻璃幕墙，造型新颖网架屋面，铺以轻钢玻璃雨棚，花岗岩大理石挂贴，铝塑板墙柱饰面，仿真石漆外墙涂料，整体建筑显得端庄，大方。杨凌车站改造工程还包括新建长550m，高1.25m旅客站台，400m长钢筋混凝土柱，彩钢板屋面风雨棚；旅客站台，地道均做了铺贴花岗岩，地砖，磁片，混凝土预制块装修。另外包括更换道岔，电力电缆，接触网供电等配套工程项目。
杨凌新火车站站舍最大旅客集聚能力2000人，各功能厅室建筑面积分别为：旅客候车厅800平方米，售票厅387.7平方米，行包房548平方米，贵宾室160平方米，办公用房378平方米，出站通道253.6平方米，锅炉房126平方米。新建站舍内给排水，电力照明，消防，通信广播，旅客运输安全检查，导向标识等专业配套设备设施齐全，完全适应接发旅客需要。站舍主体工程还包括室外道路，围墙，消防水池泵房，绿地等配套项目。
原杨陵镇火车站始建于1936年，位于杨凌示范区内，在候车面积、功能设施、整体形象等方面已经不能满足城区发展和旅客出行的需要。特别是铁路提速后，很多中间站停止客运作业，西安至宝鸡间目前办理客运作业的仅有咸阳、武功、杨凌、蔡家坡等为数不多的几个车站，咸阳距离西安太近，而杨凌车站东距西安85km，西距宝鸡88km，地处西宝段中间。
其于以上原由，为了改善杨凌示范区铁路客货运条件，优化投资环境，满足杨凌示范区日益发展的物流需要，在铁道部和陕西省的大力支持下，路地双方共同投资2200多万元，对杨凌火车站进行扩建改造。
