甘肃省公安厅重点工程公安局是甘肃省政府根据国务院关于中央企业分离办社会职能的精神，于2006年12月8日批准成立，其前身是中国铁道建筑公安局和中国铁路工程公安局在甘肃的分支机构。通过一年的筹备建设，在甘肃省财政厅、人事厅、国资委、省编办、中国铁道建筑总公司等单位的全力支持下，在揭牌之日已正式开展工作。
重点工程公安局的主要职能，是负责省级以上在建的重点工程施工现场的公安保卫工作，指导、检查重点工程施工企业内部的安全工作，参与调查处置重点工程重大安全生产事故和治安灾害事故，直接侦办涉及重点工程建设安全的有关案件，负责中铁一局、中铁一院在甘肃的各项重点工程建设及办公、生活区域的安全保卫工作，确保生产建设安全。
目前，甘肃省公安厅重点工程公安局有民警40名，分别来自原铁道建筑公安局第二十一公安处和铁路工程公安局第一公安处第十分处两个公安机构。