新疆班要全面贯彻国家的教育方针和民族政策，全面实施素质教育，始终贯彻教育工作的“三个面向”和“四个统一”的要求，为新疆培养拥护中国共产党的领导，热爱祖国，热爱社会主义，维护祖国统一，坚持民族团结，有理想、有道德、有文化、有纪律的德、智、体、美、劳全面发展，具有创新精神和实践能力，立志献身社会主义现代化建设事业的合格高中毕业生。
教育部负责制定有关新疆班的方针、政策，对工作进行宏观指导、检查、评估，以及有关协调工作。凡涉及办学体制、方针政策和招生计划等办学中的重大问题，必须逐级上报，归口教育部批准后实施。设有新疆班的省、直辖市教育厅（教委）负责业务指导和毕业生升学计划工作。
新疆班由所在市教委和新疆维吾尔自治区教委双重领导，以所在市教委领导为主。各市教委在市人民政府教育支援新疆工作协调领导小组的领导下，负责落实新疆班办学工作方针、政策，制定相关措施，会同有关部门做好协调工作，解决办学中的有关问题，确保新疆班办学工作健康发展。
新疆班学制四年，含预科一年。新疆班学生不分民族统一编班，使用汉语文授课。预科阶段重点补习初中的汉语文、英语和数、理、化课程，以达到初中毕业水平。教材统一使用教育部组织编写的预科教材。
