实际上，linux系统有两个时钟：一个是由主板电池驱动的“Real Time Clock”也叫做RTC或者叫CMOS时钟，硬件时钟。当操作系统关机的时候，用这个来记录时间，但是对于运行的系统是不用这个时间的。另一个时间是 “System clock”也叫内核时钟或者软件时钟，是由软件根据时间中断来进行计数的，内核时钟在系统关机的情况下是不存在的，所以，当操作系统启动的时候，内核时钟是要读取RTC时间来进行时间同步（有些情况下，内核时钟也可以通过ntp服务器来读取时间）
这两个时钟通常会有一些误差，所以长时间可以导致这两个时钟偏离的比较多，最简单的保持两个时间同步的方法是用软件测出他们之间的误差率，然后用软件进行修正。在每次重新启动系统的时候，系统都会用hwclock命令对时间进行同步。如果内核时钟在每一个时间中断都快或者慢的话，可以用adjtimex命令进行调整，使得RTC和内核时间走的快慢一致。
linux的内核时间实际上是记录从1970年1月1日距离现在的秒数，并且以GMT（格林尼治时间)（或者叫UTC- Coordinated Universal Time）为标准,UTC是不随着DST（夏令时）变换，需要有变化的是由应用程序自身来完成时间的转换。
通常，本地时间=UTC时间+时区
在安装linux系统的时候，可能正确设置了时区，但由于某些原因需要调整的时候，请参考以下方法
利用tzselect命令可以修改系统的当前时区，配置文件储存在/etc/sysconfig/clock文件中（Redhat As3）
linux发行版本中会带有clock（老版本）和hwclock命令，有些还可能安装adjtimex程序，系统在启动的时候会有脚本自动调用 hwclock命令，hwclock命令在设置RTC的时候，可以自动进行时钟偏移校正。注意：如果同时运行其他设置RTC的程序有可能会干扰 hwclock命令的校正功能，因此，运行这些命令的时候请只选择其中一个来运行。
adjtimex 允许用户来调整内核的时间参数，因此可以改变内核时间的速度，可以用hwclock命令来比较出内核时间和RTC时间的偏移率，然后利用adjtimex 命令根据偏移率来对内核时间进行校正，使得内核时间走的快些或者慢些，当经过调整的内核时间跟RTC时间走的同样快的时候，可以把这个命令行写到启动脚本里面，让每次机器启动的时候都可以把内核的时间参数调整正确。
