很多用户在安装NT或Win2000与linux共存同一块硬盘时时都遇到问题，导致NT或2000不能启动，这是因为NT或2000的NT loader是安装在硬盘MBR上， 而linux的lilo默认也安装在mbr之上，两者出现冲突因此导致NT或2000不能启动的问题。
其实解决这个问题有一个非常简单的方法： 首先正常安装2000或NT(如果还需要安装98则首先安装98然后安装NT或2000)，然后安装linux， 但是安装Linux时到选择lilo安装位置一步时不要选择将linux的lilo安装在MBR， 而选择将Linux的lilo安装在其主分区的boot块上。
安装完毕以后再次使用linux光盘引导系统进入安装中分区划分这一步， 但是这里并不对分区划分作修改，而是将硬盘中的active分区从以前NT或2000下的C盘修改为linux主分区，保存fdisk进行的修改以后，重新引导系统，这次使用硬盘引导系统， 将会首先进入linux的lilo选择是进入linux系统还是Win，如果选择win则进入NT或2000的的NT Loader，这样就可以选择进入win系统。