首份Windows Server 2003 Service Pack 1（简称Win2003 SP1）试用报告显示，Win2003 SP1与XP SP2同病相怜，多个微软和第三方软件不能在系统上正常运行。
微软承认，对于XP SP2，多达50个关键第三方程序，客户软件以拔⑷碜陨砣砑?荒茉谪P SP2系统上正常运行；对于Win2003 SP1，公司官员预期会有80%的服务器软件能稳定运行，剩下的20%当然是问题缠身，主要原因涉及到系统管理应用程序配置（如Windows Firewall）。Windows程序体验测试组在Win2003 SP1系统对127个服务器软件进行测试，当中包括杀毒，防火墙，备份，数据库，系统管理，财务服务器等软件。
结果显示，小部分重要的微软和第三方软件不能通过测试，列表如下：
*) Computer Associates' Brightstor ARCserve Backup 11.0;
*) Hewlett Packard's Compaq Insight Manager and HP Insight Manager 4.0 products;
*) Microsoft Application Center 2000 Service Pack 2;
*) Microsoft Baseline Security Analyzer 1.2.1;
*) Microsoft ISA (Internet Security and Acceleration) Server 2000 Service Pack 1;
*) Microsoft Exchange Server 2003;
*) Microsoft Systems Management Server 2003;
*) NetIQ's AppManager 5.01 and 6.0 and Group Policy Administrator 2.0 products; and
*) Trend Micro's ServerProtect.
目前，部分软件公司已经发布相应补丁和更新，以修复自家软件在Win2003 SP1系统上运行发生的问题。当然，微软也有必要处理Win2003 SP1服务器单方的兼容性问题。
