1.重建清理
我们知道，通过注册表可以将“添加、删除程序”中的各种无法删除的卸载程序信息删除，那么你有没有想过，你在大量增删各种应用程序和硬件设备驱动程序的同时，不可避免地要向注册表中写入数据。时间长了，这些废弃的数据会越来越多，你的注册表文件也越来越臃肿，不仅使你的“酒吧”因为负担越来越重而速度越来越慢，还会经常导致“酒吧”莫名其妙地罢工或提示出错。
现在，我们就动手来将这些无用的信息删除，方法是重建注册表。首先打开注册表编辑器，在注册表编辑器中单击“文件”菜单下的“导出”命令，将现有完整包含各种软件、硬件资源的注册表导出并为其命名，如命名为dc1.reg（因为要在DOS下执行重建注册表工作，因此最好不要起中文名称）。
然后重新启动计算机进入DOS状态（不能用Windows 98 中的DOS模式，重建注册表时Windows 98 不能运行），然后执行下述命令；
regedit/c dc1.reg（c与文件名之间应留一空格）
regedit/c表示从后面指定的文件中重新生成整个注册表。完成后再启动计算机进入Windows 98 ，你会发现重建的注册表文件比原来小了很多（视Windows 98安装后安装和卸载程序的多少而定）。这样经过“减肥”会使Windows 98的运行效率得到提高。
不过需要注意的是，用这种方法重建注册表时一定要注意的DOS的版本，一般计算机只安装了Windows 98的没什么问题，如果计算机同时安装了多个操作系统，进行此项操作最好在DOS 7.0下进行，至少也应在DOS 6.22下进行。Windows 98重建注册表需要很长的时间，以本人计算机为例，赛扬300A，升技BH6主板，64M PC100内存，昆腾火球7代6.4G硬盘，导出的注册表大小为5.86M，重建注册表约耗费了1小时，所以朋友们在进行这项操作前，最好能先加载磁盘高速缓存程序Smartdrv以便加快处理速度，同时在重建注册表前应先将原有的注册表进行完整备份，以免发生不必要的问题。
2.清理注册表中的软件信息垃圾
虽然现在绝大多数基于Windows 98 的软件都自带了卸载程序或是为Windows 98的“添加/删除程序”提供了卸载信息，但它们并不自觉地在退出历史舞台时将自身删的干干净净，大多数在卸载时并不会将注册表中的相关信息文件（这些信息主要是软件在初始安装时写到注册表中的有关生产商、ID号、用户名等）删除，导致注册表越来越庞大，无用的软件信息垃圾越来越多。我们可以在注册表中用手工方式删除这些无用的信息：
在注册表中依次打开“HEKY－CURRENT－USER\software”，它的下面包含的主键一般以软件生产商命名，如微软件出品的一系列软件都包含在“Microsoft”主键项中。如果确信某些软件已被删除，就可以将其键值全部删除。
