第四步，内核初始化，过程如图五所示，当内核加载阶段结束时，内核就开始初始化，然后Ntldr就把系统的控制权转交给内核。这时屏幕上会显示图形界面，并带有一个状态栏指示加载状态。成功的初始化之后，首先，内核会使用检测到的硬件数据，在注册表中创建HKEY_LOCAL_MACHINE\HARDWA项。其次的工作是内核通过复制HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\Select子键Current项引用的控制集创建Clone控制集。接着内核开始进一步加载和初始化设备驱动程序。最后，Session Manager（Smss.exe）按顺序启动Windows 2000更高一层次的子系统和各项服务。
图五
第五步，系统登陆，过程如图六所示，系统首先启动Winlogon.exe,随后启动Local Security Authority(Lsass.exe)，这时屏幕显示出登陆对话框。然后系统执行Service Controller(Screg.exe)再次扫描注册表HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control项并自动加载其中系统的或用户的服务。至此，用户已成功的登陆到了Windows 2000系统，系统随后把Clone控制集拷贝到LastKnownGood控制集。以上五步顺利结束之后，才可以称之为Windows 2000的完美引导过程。
图六
二、 关于高级引导
在正式引导系统之前，也就是第二步的第三项操作之前，如果按下F8键，就会进入高级引导选项，表二简要给出了高级引导的选项及它们的功能，可供您引导系统时参考
表二
三、关于Boot.ini文件
上边第二步曾提到过Boot.ini文件，这个文件存储在系统盘根目录，它的作用是定位加载的操作系统硬件位置，特别是在安装了多重系统时用来实现选择启动的功能，以下是一个标准的Boot.ini文件，我们将对此作适当解析。
[boot loader]
timeout=30
default=multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINNT
[operating systems]
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINNT="Microsoft Windows 2000 Professional" /fastdetect
C:\= "Microsoft Windows 98"
Boot.ini文件包括[boot loader]、[operating systems]两个部分，[boot loader]包括等待时间和默认引导系统两个参数，timeout后边的数字表示等待的秒数，default后边的是默认引导系统的位置。[operating systems]则包括安装的所有系统的ARC(Advanced RISC Computing)引导路径（等于号之前的部分）和他们在菜单上显示出的名字（引号之间的文本），以及启动参数（斜杠后边的部分）。下边的表三将详细向您解释ARC路径的含义
表三
注意，在multi、scsi、disk和rdisk序号都是从0开始的partition是从1开始的。下边的表四将向您解释常用启动参数的意义。
表四
因为boot.ini是系统保护文件，它隐藏在系统盘根目录下，并且具有只读属性，如要修改请先到文件浏览器的工具―〉文件夹选项―〉查看中选中显示所有文件和文件夹，取消隐藏受保护的操作系统文件，并且取消boot.ini文件的只读属性，方可使用记事本之类的编辑器编辑它。
