位于/etc目录下的XF86Config文件是XFree86的X服务器的配置文件，XF86Setup 或者xf86config在配置完后就将配置信息保存在这个文件中。XFree86也提供了一个配置文件的样例文件，/usr/X11R6/lib/X11/XF86Config.eg，可以用作参考。很多情况下需要对X的行为进行微调，而并不想重新启动设置程序重复进行整个设置过程，这样手工修改配置文件就更为方便。
有一些X服务器的参数使用配置程序并不能进行配置，必须在原有XF86Config上手工更改配置文件。
下面将以一个简单的配置文件为例进行简单介绍XFree86的设置选项。文件搜寻路径 Section "Files"
RgbPath
"/usr/X11R6/lib/X11/rgb"
FontPath
"/usr/X11R6/lib/X11/fonts/75dpi/:unscaled"
FontPath
"/usr/X11R6/lib/X11/fonts/100dpi/:unscaled"
FontPath
"/usr/X11R6/lib/X11/fonts/misc/"
FontPath
"/usr/X11R6/lib/X11/fonts/75dpi/"
FontPath
"/usr/X11R6/lib/X11/fonts/100dpi/"#
FontPath
tcp/fontserver:7000#
ModulePath
"/usr/X11R6/lib/modules"EndSection
上面是配置文件的第一部分 “Files” ，这个文件部分定义了 X Window使用的搜索文件路径，如调色板文件的路径RGBPath，字体路径FontPath，以及ModulePath用来设置X服务器的动态可加载模块的路径。
其中字体路径可以使用多行来设置多个路径，也可以在一行之内设置多个路径，路径之间使用逗号分隔。字体路径也能定义为网络上的字体服务器，这需要指定协议、主机名和端口地址，例如tcp/fontserver:7000表示一台名为fontserver的字体服务器使用tcp端口7000提供字体服务。Unscaled用于修饰表示对这个路径下的字体不进行缩放处理，处理固定字体可减少系统资源的消耗。使用字体服务器可以让多个服务器同享字体，从而达到节约磁盘空间的目的。
在行首使用符号 “#” ，表示这一行为注释，并不被X服务器处理。可加载模块 # Section "Module"# Load "xf86Jstk.so"# EndSection
如果前面Files部分定义了ModulePath，这个"Module"部分就用来装载相应路径下具体的模块。一般情况下，并不需要使用这个功能，除非是使用了一些非标准的功能，需要可加载模块的支持，如xf86Jstk.so就是一个游戏杆的驱动程序。
