为了电脑的安全或加快系统的启动速度，我们一般在BIOS中设置为优先从硬盘启动系统，可是一旦碰到需要用启动盘引导系统的情况时(如在DOS下彻底杀灭病毒、升级BIOS等)，就要先进入BIOS修改，完成任务后又要再次进入BIOS将相关设置改回来，十分麻烦，难道就没有一种鱼与熊掌兼得的方法吗？
解决问题的思路
安装Windows 98与windows 2000/XP双系统的朋友都知道，在C盘的根目录下有一个启动治理器的启动配置文件boot.ini，在该文件的[Operating Systems]小节中有一句：C:＼="Microsoft Windows"，它是一种缺省用法，它的完整用法是：C:＼BOOTSECT.DOS="Microsoft Windows"，其中BOOTSECT.DOS是Windows 98的引导扇区文件，隐藏在C盘的根目录下，引号内的Microsoft Windows是引导Windows 98启动的菜单项。该句的作用是：从“启动菜单”上选择Microsoft Windows，启动治理器就从BOOTSECT.DOS文件中引导Windows 98启动。
从上述双操作系统中启动Windows 98的过程中可以得出如下结论：假如把启动盘的引导扇区提取出来做成一个文件保存在C盘的根目录下，并相应地修改boot.ini文件中的相关语句，就能实现从“启动菜单”上引导启动盘启动系统，从而避免了修改BIOS。
实施步骤
1.安装Windows 2000/XP的启动治理器
在Windows 2000/XP或Windows 98与Windows 2000/XP双系统中已经安装了启动治理器，下面介绍在Windows 98安装启动治理器的过程。
在Windows 98中运行Windows 2000/XP安装光盘上的安装程序，选择“全新安装”，一直安装到启动时出现“Microsoft Windows”与“Microsoft Windows 2000/XP安装程序”的启动菜单，此时已安装好Windows 2000/XP的启动治理器，选择“Microsoft Windows”进入Windows 98，将硬盘各分区中所有以址凡⒁灾符结尾的文件删除。
2.制作启动盘的引导扇区文件
下面介绍用Windows 98/2000/XP系统中自带的DEBUG工具制作启动盘的引导扇区文件的方法：
先将启动盘插入软驱，然后在Windows 98/2000/XP的命令提示符下输入DEBUG并回车，然后在DEGUG的提示符“-”下按顺序输入以下命令并回车：
-L 100 0 0 1
-RCX
:200
-N C:＼FBOOT.DOS
-W
-Q
说明：第一行命令是将启动盘的引导扇区读入内存，第二、第三行命令是将引导扇区文件的大小设置为200B(200B是十六进制，即十进制的512B)，第四行命令是给引导扇区文件命名为FBOOT.DOS，读者可根据自己的爱好进行命名，第五行命令是将内存中引导扇区中的数据写入FBOOT.DOS文件中，写入完成后屏幕上会显示“write 00200 bytes”(写入文件的大小为200B)，表明你引导扇区文件已经制作成功，输入第六行命令Q退出DEBUG。
3.修改boot.ini
在Windows 98系统中boot.ini文件修改如下：
[boot loader]
timeout=O
default=c:＼
[operating systems]
C:＼="Microsoft Windows"
C:＼FBOOT.DOS="从启动盘启动系统"
在Windows 2000/XP系统中，在[Operating Systems]小节下添加：C:＼FBOOT.DOS="从启动盘启动"，并将timeout的值修改为0。
从启动盘启动系统
完成上述操作后，重新启动电脑，假如这时需要从启动盘启动系统，就按F8进入“Windows高级选项菜单”，选择“返回到操作系统选项菜单”，按回车键进入“启动菜单”将启动盘插入软驱，再选择“从启动盘启动系统”即可从启动盘引导系统。假如不需要从启动盘启动系统，无需任何操作就可以快速启动你的Windows 98/2000/XP系统了。