卡片上的每个小应用程序由一个application标识符（AID）唯一标识。 定义在ISO 7816 - 5中的AID是一段5到16字节之间的序列。 所有的小应用程序必须扩展Applet抽象基本类，这个类定义了JCRE使用的方法来控制小应用程序的生存周期，如图10概括：
图表1. java Card小应用程序生命周期方法
小应用程序生存周期在小应用程序被下载到卡片中并且JCRE调用小应用程序的static Applet.install ()方法的时候开始，并且小应用程序通过调用Applet.register ()在JCRE中注册。 一旦小应用程序被安装并且注册，它处于未选择的状态，可以进行选择并且处理APDU。 图表11.总结小应用程序方法的操作。
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图表2、使用 Java Card小应用程序方法
当处在未选择的状态的时候，小应用程序是非激活状态。当主应用程序要求JCRE选择一个卡片中特定的小应用程序的时候（通过指示读卡器发送一个SELECT APDU或者MANAGE CHANNEL APDU），一个小应用程序被选择进行APDU处理。为了通知这个小应用程序主应用程序已经选择了它，JCRE调用它的select()方法；小应用程序一般执行相应的初始化来为进行APDU处理做预备。
一旦选择，JCRE传送输入的APDU命令到小应用程序，通过调用它的PRocess()方法来进行处理。JCRE捕捉任何小应用程序没能捕捉的异常。
当主应用程序告诉JCRE选择另一个小应用程序的时候，前一个小应用程序取消选择。 JCRE通知活动的小应用程序，它已经通过调用它的deselect()方法被取消了选择，小应用程序回到不活动的未经选择的状态。
Java Card会话和逻辑通道
卡片会话是卡片被加电并且和读卡器交换APDU的一段时间。
Java Card 2.2支持逻辑通道（logical channels）的概念，答应最多智能卡中的16个应用程序会话同时开启，每个逻辑通道一个会话。因为卡片中的APDU的处理不能中断，并且每个APDU包含一个到逻辑通道（在CLA字节）的引用，变动的APDU可以拟同步地访问卡片上的许多小应用程序。你可以设计一个小应用程序被多次选择；也就是说，每次和一个以上逻辑通道通信。多选的小应用程序必须实现javacard.framework.MultiSelectable接口和相应方法。
在一些卡片部署中，一个默认小应用程序可以被定义为在卡片复位以后被自动地选择，用于在基本逻辑通道（通路0）上通信。Java Card 2.2答应你定义默认小应用程序，但是不指定的如何做；其机理由厂家特定。进入讨论组讨论。