ERP主要是一个计划与控制系统，集成企业内外业务流程上的各种管理信息。作为一种规范化信息化管理模式，严格控制业务流程按照规则办事，处处体现质量保证体系的要求。ERP和ISO9000之间有许多共同点，举例如下表。实施ERP系统与通过ISO9000认证是相辅相成的，不少企业在实施中都深有体会。
一些ERP系统增加了质量管理功能模块，多数是用来记录、统计和查询有关质量管理的信息。如检验标准和技术条件、抽样标准、检验结果、检验设备的能力和计划、返修及废品统计、售后质量问题反馈、质量原因分析等；最突出的功能是批量控制和批号跟踪，包括并批和拆批的供需双向跟踪。质量管理模块在沟通部门间交流质量信息方面有重要作用，有利于改善产品质量。但是，在ERP系统中，涉及质量保证体系的功能不是只靠一个质量管理模块，而是渗透在系统的各个环节之中。在ERP系统里还有许多功能都是保证质量不可少的，除了批号跟踪外，还有诸如用设计更改程序控制对物料清单及工艺文件的更改；对不合格品的降级使用或废弃等库存事务处理、以及其在财务上的影响等等。我们知道，质量是客户定义的；广义上讲，下道工序就是上道工序的客户。没有投诉，不等于客户满意。
在市场竞争的环境下，达到标准只是最起码的最低要求。我们的工作要以基本质量标准为出发点，使客户得到超出一般标准的意外满足，创名牌，占市场。今天的意外满足，可能明天又成为一般标准；应当用进取不懈的精神来认识质量标准。
实施ERP对通过ISO9000论证能起到相当大的促进作用，但是不能理解为实施了ERP系统就“一定”能通过ISO9000。有些企业先通过了ISO9000认证，如果认证工作是严格和认真的，按照ISO9000建立的一些文档资料对实施ERP会有很大帮助，能缩短ERP的实施周期。反之，有了ERP系统，又会巩固 ISO9000认证的成果，并不断提高企业的质量水准。先实施ERP还是ISO9000，要根据企业的条件和需要的重要性，并无定论。但是，无论是实施ERP或是ISO9000，工作都很繁重，如果同时实施，会增加难度，要根据企业的具体情况而定。
通过了ISO9000，并不等于产品质量就得到保证，生产毒奶的企业，不都是通过ISO9000了吗？要记住质量管理的一句名言：“质量是做出来的，不是检验出来的”，需要树立全员质量意识和为客户增值的企业文化，才能持续不断地为社会提供优质的产品和服务。
