亚青寺始建于公元1985年，由大圆满成就者 喇嘛阿秋仁波切住持。建在四面环山的草原湿地上，有数千间信徒居住的小木屋，纵横交错的河流包围了整个寺庙的建筑群，每当清晨或黄昏，炊烟弥漫，河水闪耀着金光，颂经声随风远远传来，犹如天籁，动人心弦。主传宁玛巴大圆满实修教法耳传窍诀(成熟口诀法)——极密心滴部之车却（直断）、脱嘎（顿超） 。并严格要求弟子闭关实修。
在亚青寺修学，生活条件极为艰苦，交通不便物资匮乏，寺院至今未通电。可这一切并未能阻止有志实修者的脚步，2000年时汉族四众弟子已达百余人，常住修学的汉族弟子亦有五十余人。亚青寺现常住有四千余僧尼，以河为界分为扎巴、尼众两区，共八个洲。扎巴（出家男众）区分为五个洲：法性光明洲、轮涅法性洲、普贤静虑洲、大乐解脱道洲、明体自解脱洲；尼众（出家女众）区分为三个洲：乐空双运洲、普贤大乐洲及二谛双运洲。
亚青寺的“圆满光明殿”（亚青寺大经堂的名称），是仿照著名的桑耶寺主殿“邬孜大殿”而建，外形气势磅礴，内有１６０根柱子组成，这一切都有着深远的喻意。