电脑使用时间长了后，系统中产生的碎片也会随之增加，所以我们最好定期使用碎片整理程序来进行碎片整理，提高系统性能。
一般情况下，在整理了磁盘碎片后，会发现碎片整理报告中有一项“未经过碎片整理的文件”，那下面常常会列出一长串没有被整理的文件名。这些未被整理的碎片大都是正处于运行状态的系统文件，而操作系统是不允许整理这些文件的。
如果想更彻底进行磁盘碎片整理，可以把系统启动到“安全模式”状态下整理。因为当系统启动到“安全模式”状态下时，只会加载必需的驱动程序和系统文件，而不会加载其它多余的程序。而且操作系统在“安全模式”下占用的内存空间较少，就会有更多的内存用来碎片整理，提高整理速度。