君子兰的花是由数十朵喇叭状的小花组成的伞形花序。每朵小花都是雌蕊、雄蕊兼有的完全花。雌蕊1枚在中间伸出，雌蕊6枚较短而围在四周，因此雄蕊上的花粉就不容易自然落到雌蕊的柱头上，致使君子兰开花不结实，早落果。为了获得种粒饱满，发芽力强，数量多的君子兰种子，需要进行人工辅助授粉。人工授粉时，用新毛笔蘸取雄蕊上金黄色小花粉粒，轻轻涂抹在雌蕊柱头上，第2、第3天重复授粉2次；也可用镊子把雄蕊摘下，使花粉直接接触柱头，授粉效果更好。君子兰的种子成熟期较长，需8~10个月，种皮由深绿色转变为红色或紫红色时即成熟。