慢性前列腺炎的治疗是临床上十分棘手的一项工作。其原因除了该病的病因复杂，尚未完全清楚之外，还与以下几个因素有关。
1、解剖因素
① 前列腺的位置深在，其分泌液需经前列腺管排入尿道后再排出体外。前列腺组织可以分成中央区和外周区，中央区的前列腺管与射精管平行进入尿道，分泌物容易排出。外周区的前列腺管与尿道呈直角或斜行进入尿道，分泌物不易顺畅排出；相反，病原微生物反而容易逆行进入腺体。
② 前列腺内局灶性炎症不易诊断，而且常因病灶周围有腋痕包绕并缺少血管，是药物治疗不良的原因之一。
③ 前列腺内的炎症病灶不一定与尿道相通，因此引流不畅致炎症不易消退。
④ 因毗邻关系慢性前列腺炎常与慢性尿道炎、膀胱炎以及精囊炎同时存在，互为因果。
2、生理病理因素
① 前列腺体表面有一层脂质包膜，大多数抗生素难以透过这层包膜进入前列腺体内发挥治疗作用。
② 病灶及其周围硬化，不利于药物扩散。
③ 迄今对前列腺感染的原因尚未完成清楚，预防、治疗均感困难。
④ 男青年性兴奋性强，较频繁的性冲动可引起前列腺反复充血；未婚男青年缺乏规律生活可导致前列腺液难以规律地引流，产生淤滞、发炎。
⑤ 慢性前列腺炎并非全因细菌感染所致病，还有病毒、支原体等多种病原微生物侵入引起的感染和无任何病原微生物入侵的无菌性前列腺炎。
显然，非细菌性感染引起的前列腺炎和无菌性前列腺炎用抗生素治疗当然无效，这也是临床医生惯用抗生素治疗慢性前列腺炎疗效欠佳的一个重要原因。
