我们感兴趣的是，在有像超级链接构造那样的互相参照关系的时候，定量地知道哪一个页面是最「重要」的。换句话大胆地说，这个也就是严密计算「应该从哪一页开始读取」这个指标的过程。就算从谁都不看的小页面开始读取也没有办法。
那么，一般地说为了使得像 Web 那样的超级链接构造能够反映在在排列次序上，需要在计算机上建立超级链接构造的数字模型。 怎么模型化需要取决于安装者的方针所以一概而论，但是如果应用图表理论来观察超级链接构造的话，最终常常回到线形代数考虑方法上去。这对于 PageRank 也是一样的。
计算方法的原理 作为最基本的考虑方法，就是用行列阵的形式来表达链接关系。从页面 i 链接到另一张页面 j 的时，将其成分定义为1，反之则定义为 0 。即，行列阵 A 的成分 aij 可以用，
aij＝1 if (从页面 i 向页面 j 「 有 」 链接的情况) 0 if (从页面 i 向页面 j 「没有」链接的情况)
来表示。文件数用 N 来表示的话，这个行列阵就成为 N×N 的方阵。这个相当于在图表理论中的「邻接行列」。也就是说，Web 的链接关系可以看做是采用了邻接关系有向图表 S。总而言之，只要建立了链接，就应该有邻接关系。
(*注)由点和点连接的线构成的图形被称为「图表(graph)」。这些点被称为「顶点(vertex)」或者「节点(node)」；这些线被称为「边(edge)」或者「弧(arc)」。图表分为两类，“边”没有方向的图表被称为「无向图表(undirected graph)」，“边”带有方向的图表被称为「有向图表(directed graph)」。把有向图表想像成单向通行的道路就可以了。 图表能用各种的方法来表示,但一般用在数据结构上的是「邻接行列(adjacency matrix)」和「邻接列表(adjacency list)」。需要注意的是，如果是无向图表，邻接行列 A 就成为了对称行列,而如果是有向图表，A 就会成为不对称行列。
以下是用位图表示的 Apache 的在线手册(共128页)的邻接行列。当黑点呈横向排列时，表示这个页面有很多正向链接(即向外导出的链接)；反之，当黑店呈纵向排列时，表示这个页面有很多反向链接。
500)this.style.width=500;" onmousewheel="return bbimg(this)"
邻接行列的例子(采用了Apache 的在线手册)
PageRank 的行列阵是把这个邻接行列倒置后(行和列互换)，为了将各列(column)矢量的总和变成 1 (全概率), 把各个列矢量除以各自的链接数(非零要素数)。这样作成的行列被称为「推移概率行列」，含有 N 个概率变量，各个行矢量表示状态之间的推移概率。倒置的理由是，PageRank 并非重视「链接到多少地方」而是重视「被多少地方链接」。
