日本官房长官盐崎恭久2月5日对中国船只超范围海洋调查表示不满，指出中国的行为“不恰当”，并警告不希望看到同样事情发生。中国海洋调查船“东方红二号”4天上午9点半左右进入钓鱼岛西北偏西约30公里的海域进行调查活动。调查船于4日晚10时后驶离钓鱼岛海域，日本海上保安厅称是派员前往“驱离”，并正式向中国提出了抗议。
英国广播公司（BBC）报道，官房长官盐崎恭久当天在记者会上说，中国在没有事先通知的情况下进入日本专属经济水域“是不恰当的……我们强烈希望类似活动不被重复。”
据日本官方透露，基于两国间达成的协议，中国事前曾通报日本政府将于1月18日至2月15日在鹿儿岛县以西的“日中中间线”附近海域进行调查。但是，“东方红二号”脱离了上述海域，在日本专属经济水域内向南航行，途中向海中抛下各种器具，可能是采集海水进行调查。
中国海洋调查船“东方红二号”已于4日晚10时后驶离钓鱼岛海域。共同社引述日本海上保安厅称，由于“东方红二号”不是一艘民用船只，而是一艘探测船，而且它进入的海域是相当敏感的“争议海域”、“钓鱼台海域”，因此日本海上保安厅派员前往“驱离”。
日本海上保安总部称，中国调查船在多次警告后仍然进行海上调查，最终日本巡逻艇进行了逐赶。从2006年开始，中国至少已经七次派船到相关海域进行探测活动。
日本海上保安厅表示，中国事前曾向日本通报，会在1月18日至2月15日间在鹿儿岛西侧的东海进行调查。但是，“东方红二号”脱离了上述海域。日本表示，在中国调查船进入了钓鱼岛西北的日本专属经济水域之后，日本已经正式向中国提出了抗议。日本外务省在一份声明中说，“日本强烈抗议中国船只的举动，并要求这艘调查船停止有关活动。”日本海上保安总部称，中国调查船在多次警告后仍然进行海上调查，最终日本巡逻艇进行了逐赶。转自
中日有关钓鱼岛（日本称：尖阁诸岛）的主权争执是历史遗留问题，长期未能解决。清政府1895年《马关条约》中将台湾及钓鱼台列岛割让给日本国。
主岛钓鱼台位于台湾基隆港东偏北约186公里处、浙江温州港东南约356公里处、福建福州长乐国际机场东偏南约385公里处、日本冲绳那霸空港西偏南约417公里处。钓鱼台列屿各岛因淡水不足、泥土不厚、风浪较大，不适定居，属无人岛屿。
美国1972年将琉球主权移交日本时，一并将钓鱼台列屿的行政管辖权也交给日本，将钓鱼台列屿主权问题留予台湾、中国大陆及日本解决。目前，钓鱼台列屿实际由日本管治，划归冲绳县石垣市，日文名称“尖阁诸岛”。
台湾海峡两岸的政府均对钓鱼台列屿声张主权，划归台湾省宜兰县头城镇大溪里。中国大陆和台湾、香港及海外华人民间自1970年代开始，也曾多次登岛或试图登岛以宣示主权，称为“保钓运动”。
