人体表面（包括呼吸道、消化道、泌尿生殖道、外耳道等）生长着各种各样的微生物，它们有的和人是共生关系，有的则是互生关系，他们的存在可以有效地抑制外来微生物的侵入，保护人体的健康。这些微生物统称为人体正常菌群。在病理情况下，尤其是使用抗生素情况下，人体某些部位的正常菌群遭到破坏，有些外来病原微生物占据了主导地位，这时人体这些部位就会患炎症。比较常见的，如有的女性为了“干净”，经常用含有抗生素的洗液洗阴道，这样使在阴道里以乳酸杆菌为主的正常菌群遭到破坏，从而使霉菌、白色念珠菌甚至毛滴虫等大量生长，导致阴道炎。因此，抗生素一定要在医生指导下使用，绝不要滥用。
人体内不仅有许多有益菌，还有许多有害的细菌，菌群失调就是因为服用抗生素引起的体内的有益菌大量的失去，会引起腹泻等一系列的问题。喝一点酸奶或补充一些有益菌。