动画片《机甲兽神第2部》剧情梗概：大结局
炎部落一战之后，延羽、嘉静、凌义、基洛、希阳五人回到金波城，这时却突然收到土元素城市——沙砾市受到邪灵组织入侵的消息，五人立刻赶往沙砾市，却发现这里出现了五个冒充机甲五勇士的人，原来这些人冒充延羽五人是为了从沙砾市酋长口中得出沙砾市能源石——灵土矿石的位置。最后在延羽五人的努力之下，终于揭发了假五人组的身份，与此同时，却让邪灵得知了灵土矿石散落在地下的秘密！
为了守护灵土矿石，延羽五人兵分两路，延羽、基洛、希阳前去寻找传说中守护灵土矿石的灵驼。凌义、嘉静二人留守沙砾市，这期间凌义发现本已死去的哥哥凌浩竟成为了邪灵组织的一员，并与自己为敌！面对哥哥的攻击，凌义数次不忍下手。而另一边，延羽三人于沙漠之中遇到了小骆驼——薯太郞。茫茫大漠中，延羽与薯太郎互相帮忙，结下了深厚的友谊，却在一次邪灵的进攻之中，延羽为了保护驼群受了重伤！为了救延羽，薯太郎带着一众人前往生命之源，原来薯太郎就是传说中的灵驼。不料，邪灵组织竟悄悄尾随着延羽一众人。眼见生命之源的封印即将被修服之际，邪灵组织的铁拿与毕胜突然杀出，延羽在危急之中召唤出新的机甲——无双龙神将敌人成功击退，生命之源亦在灵驼的修服之下沉入地底。
延羽五人再次汇合，这时邪灵组织却已经得到灵土矿石的地下分布图，正意图制造吸取装置将地下的灵土矿石力量聚集起来。毕胜更以凌浩为由要胁凌义加入邪灵组织。延羽一众人为探出邪灵的大本营，将计就计，凌义故意叛变，深入邪灵，探得吸取装置的位置，与延羽一众人里应外合。一场惨烈的大战，凌义为了同伴为了保护沙砾市将凌浩击败，基洛亦在战斗之中机甲被击至粉碎，在众人的努力之下，终于将邪灵大将毕胜击败。
当一众人以为一切将平息之际，却发现完全联络不到在金波城的延、林博士。一众人返回金波城的途中，解救了被邪灵追杀的少年向荣，并在误打误撞之中，得知向荣亦与邪灵有着不共戴天之仇，且从向荣口中得知邪灵将延、林两位博士捉住是为了得到金波城的能源石——黄金圣杯。同时嘉静一众人也查得邪灵为了研制最强机甲千方百计要得到一块灵狮化石。于是一众六人决定兵分两路前去寻找灵狮化石及黄金圣杯的下落。
延羽、希阳、向荣为寻找黄金圣杯，前去拜访延、林博士的老师——达尔文，却想不到达尔文因为心爱的宠物被机械害死，不但不表露身份，还偷走延羽几人的召唤器。不料这时候邪灵组织的罗煞出现，千均一发之际，被延羽一众人所救，并因此感化了达尔文。另一边，嘉静、凌义、基洛三人根据林木博士的指示前去寻找灵狮化石，在开采机械人罗密欧的帮助下终于发现了化石，这时却突然遭到邪灵的袭击，基洛利用灵狮化石成功召唤出来的烈火灵狮也在战斗中消失。一众人决定立刻赶回研究所研制烈火灵狮，却不料途中遇到邪灵的埋伏，危险之际延羽众人出现相助，烈火灵狮亦在争分夺秒之下被研制出来，并成功击退了敌人！
就在此时达尔文却告诉一众人金波城早已没有了能源石——黄金圣杯，众人感觉救父无望之时，达尔文却发现了延、林博士发射出的求救信号，二人正被囚禁在邪灵的空中堡垒之中。经过一场危险的潜入战，众人终于救出了两位博士，向荣却因为帮助延羽一众人逃脱而被邪灵捉住，而此时，一众人方发现向荣竟是邪灵统帅希特的儿子！
延、林两博士被救出后得知金波城已没有能源石一事后，决定要先邪灵一步找出支撑着整个金波城运作的‘中枢计算机’。不料这一切被罗煞全部监听到！罗煞并借此机会杀害了希特，并以希特为延羽众人所杀为由令向荣归顺邪灵。
与此同时，延羽众人得知邪灵以得到中枢计算机下落之后，紧急前往阻止，却不料面对强大的邪灵势力及向荣的百般阻拦，不但机甲损害，凌义更因此牺牲了自己的机甲令延羽得以进化成合体机甲！
带着不惜一切都要阻止邪灵统治世界的决心，一众人重振士气再次朝已被邪灵控制的中枢塔出发。嘉静、希阳、基洛以调虎离山之计令延羽成功潜进中枢塔。顺利进入塔内的延羽却重遇罗煞，危急之际，向荣出现，原来向荣一直留守在邪灵就是为了找出中枢计算机趁机将邪灵一举歼灭！却不料，中枢计算机的能量仍被逆转，世界渐渐开始机械化，罗煞更因此令所驾驶的末日战神力量加强，眼看延羽渐不敌之际，凌义竟突然出现，救下了一众人。集合了延羽、凌义、嘉静、希阳、基洛的五大元素能量，终于将罗煞击败！
却不料中枢计算机并没因此被停止，世界仍持续机械化，唯一的办法就是利用机甲召唤器中的陨石能量！经过一番痛苦挣扎，五人终于明白机甲兽神最终的使命是守护这个世界，五人决定忍痛挥别机甲！
机械化能量渐渐消散，世界再次恢复了和平。
动画片《机甲兽神第2部》分集剧情介绍：
《机甲兽神第2部》分集介绍：第27集真假五勇者
在炎部落，延羽五人与邪灵组织大战一场后，终于获得了短暂的平静，在金波城过着幸福、和平的日子。嘉静总算可以与林博士继续他们的球赛，希阳则领着凌义、基洛两人尝遍了城中的所有美食，而延羽一家也终于可以团聚了！可是快乐总是短暂的……
此时在世界的另一端——沙砾市，沉寂多时的邪灵组织突然出现，四处破坏环境，攻击人类。当人们面对强大的邪灵机甲束手无策之际，出现在沙砾市民面前保护他们的，竟然是驾驶金角武神、飞翼武者等机甲的机甲五勇者……远在金波城的延羽众人，竟然会突然出现在沙砾市！？为了查清真相，延羽众人决定前往沙砾市，查探邪灵的踪迹及拆穿机甲五勇者的身份。可是，当延羽众人到达沙砾市的时候，却发现机甲五勇者正与邪灵机甲展开了激烈的战斗，并且保护了沙砾市民的安全。延羽众人见状不禁如坠迷雾，弄不清这些冒牌货的真正目的了。而这一切的背后却有一强大势力在策划着阴谋……《机甲兽神第2部》分集介绍：第28集调查真相
为了调查邪灵组织的目的和机甲五勇者的身份，延羽一行五人决定暂时留在沙砾市。而因为机甲勇者的身份被盗用，延羽众人在沙砾市吃尽苦头，处处受到沙砾市民的排挤与嘲笑。延羽几人为了夺回身份，决定在机甲五勇者开交流会之日，揭穿他们的假面目。与此同时，凌义、基洛则趁机潜入他们的豪宅，寻找证据，而当两人发现了冒牌机甲的秘密时，邪灵组织的队长铁拿竟然带着邪灵兵杀到，将凌义和基洛两人抓住了！那边厢，延羽、嘉静、希阳本想在交流会上揭穿机甲五勇者的假面具，却反被机甲五勇者几人讥笑为追星族，成为全场笑柄。延羽气愤不已，欲召唤机甲以证身份时，却发现凌义和基洛竟然被这五个冒牌货抓住且作为要挟，延羽迫于无奈只得离场。
但为了救出同伴，延羽三人决定前去拦截机甲五勇者的轿车。当金角武神向着冒牌的机甲勇者逼近之际，嗜血天蝎突然从一旁的丛林中冲出，全数挡下延羽的攻击。此时只见驾驶嗜血天蝎的人竟然是凌浩！
《机甲兽神第2部》分集介绍：第29集保护酋长
延羽驾驶金角武神激战凌浩的嗜血天蝎，两人互不相让，一时间难分高下。同时，希阳和嘉静两人兵分两路，正前去寻找凌义、基洛。那边厢，毕胜正命令机甲五勇者尽快从酋长身上套出灵土矿石的秘密！希阳得知邪灵要对酋长不利，心急不已，夺回凌义、基洛的机甲召唤器后冲忙出逃。而此时，嘉静带着凌义、基洛顺利逃出了豪宅，正当众人以为成功之际，却突然遭到了盾甲铁刺的攻击。嘉静为了保护失去机甲的凌义、基洛，驾驶飞翼武者奋力抵抗盾甲铁刺的猛烈攻击。嘉静危急之际，希阳赶到将召唤器交给凌义、基洛两人。啸海帝鳄和赤焰战虎、象影神兵及时出现，抵挡住盾甲铁刺，救下了嘉静，并合力将盾甲铁刺击退。
经历了一夜战斗，延羽众人却未能休息，必须赶在邪灵组织之前，将酋长保护起来。正要出发之际，又遇到嗜血天蝎的偷袭。延羽、嘉静两人冲忙赶往酋长家，却还是来迟一步！酋长竟被假冒的机甲五勇者救走了！？
《机甲兽神第2部》分集介绍：第30集灵土矿石
延羽、嘉静使计甩掉了前来阻击的铁拿后，匆匆忙忙前去追赶被带走的酋长。原来假机甲五勇者救酋长只是假象，目的是要得知灵土矿石的下落。当他们得知灵土矿石的秘密后，决定将酋长杀人灭口。千钧一发之际，幸好延羽和嘉静及时赶到，将假机甲五勇者打败，并且救了酋长。与此同时，凌义、基洛、希阳为了争取时间，与嗜血天蝎苦战。在战斗中，因凌浩突然忆起了过去的回忆，无法战斗，致使凌义三人乘机逃脱。而凌义也在烟尘中看见了一个熟悉的身影，不禁心生疑虑……
救下酋长后，延羽众人终于证明了他们的身份。而为了一圆做明星的美梦，延羽决定以真正的机甲勇者身份，在沙砾市展开一连串的宣传，甚至接受电视台的采访。可惜事与愿违，延羽明星做不成，反而导致笑料百出。那边厢，受伤的凌义终于苏醒过来，但是对战斗中那个熟悉的身影仍然谨谨于怀，为了证实自己的怀疑，凌义与嘉静再次到豪宅中进行调查。然而他们在邪灵的监控录像中，竟然看到了凌浩的身影！！！《机甲兽神第2部》分集介绍：第31集生命之源
邪灵组织突然偷袭了沙砾市的图书馆，延羽众人得知后急忙前[转自影视剧情频道]去阻止，不料却遇上了因再次洗脑而变得凶狠非常的凌浩。延羽四人苦苦对战强劲的盾甲铁刺和嗜血天蝎，但是凌义却因为内心的挣扎，迟迟不能出击。最终延羽四人不敌，导致古籍全数被邪灵抢走了。虽然失去了古籍，但是延羽众人没有放弃，决定兵分两路，由延羽、基洛、希阳向彩虹沙漠出发，快邪灵一步寻得守护灵土矿石的灵驼，而嘉静和凌义则留在城市中保护酋长。与此同时，毕胜也得知了生命之源的秘密，派铁拿前去沙漠抓灵驼。
延羽几人到达沙漠，为了引出灵驼布下了陷阱，可是却一无所获。但是他们不知道，此时一个黑色身影早已在暗中监视着他们的一举一动了。延羽众人引诱不成，只得在沙漠中盲目乱找，不料却遇上沙尘暴和流沙。正当延羽三人快被流沙吞没之际，一个黑色恐怖身影突然出现在延羽几人的身后……
《机甲兽神第2部》分集介绍：第32集地狱猎豚
嘉静见凌义为凌浩的事情而烦恼，担心不已。为了让凌义放松一点，嘉静答应酋长的要求，带凌义前去参加动物园的开幕仪式。不料在仪式上，邪灵组织竟突然出现，将动物园中的动物抢走。凌义和嘉静见状，连忙召唤出啸海帝鳄和飞翼武者对战嗜血天蝎。凌义不忍攻击凌浩，甘愿挨打，最终被击至重伤不醒人事。而毕胜则利用抢到手的公鹿豚，制造出了最强大的土元素机甲——地狱猎豚。
那边厢，延羽几人在沙漠中遭遇沙尘暴，幸得一只小骆驼出手相救，延羽几人才保住性命。为此延羽几人帮小骆驼改名薯太郎并且结伴一块上路。在途中，延羽众人碰巧遇上铁拿在大肆抓捕驼群。众人拼力战斗，终于救出了驼群。但是延羽为了保护薯太郎被铁箭所伤，最终金角武神能量耗尽，彻底碎裂。铁拿见金角武神消失，欲将延羽杀死。情急之下，薯太郎爆发出力量，竟然蜕变成灵驼将延羽救下。然而未等铁拿反应过来，铺天盖地的沙尘暴再次袭来，几人离散在遍目的滚滚黄沙之中……
《机甲兽神第2部》分集介绍：第33集迷雾森林
受伤的凌义丧失理智，誓要出去找凌浩问个清楚，却遭到嘉静的极力阻止。两人争吵之时，不慎被酋长听到了一切。在嘉静和酋长两人的劝说下，凌义终于冷静下来，决心先寻找恢复哥哥记忆的方法。
与此同时，希阳、基洛两人终于找到了失散的薯太郎和延羽，却发现延羽因为伤重而昏迷不醒。为了帮延羽疗伤，希阳和基洛在薯太郎的带领下，穿过了迷雾森林，到达了生命之源。正当众人开心之际，铁拿突然带着邪灵兵杀到，原来铁拿一直都跟踪在众人身后。希阳、基洛见状，两人连忙召出机甲抵挡铁拿，薯太郎则趁机冲进生命之源。而当基洛、希阳打败了盾甲铁刺，毕胜竟驾驶地狱猎豚突然杀出，希阳两人面对新敌人惊愕不已。那边厢，延羽在灵土矿石的力量下渐渐苏醒过来，此时方见薯太郎竟是灵驼。当薯太郎修复灵土矿石封印之时，毕胜突然冲出要将薯太郎杀死。为了保护薯太郎，延羽奋不顾身挡在薯太郎面前。失去机甲的延羽面对强大的地狱猎豚，命悬一线！《机甲兽神第2部》分集介绍：第34集无双龙神
延羽为了保护同伴，毅然以身体挡在地狱猎豚之前。千钧一发之际，延羽的手镯竟然自动修复了，并召唤出全新的机甲——无双龙神。由于无双龙神的力量过于强劲，地狱猎豚渐渐招架不住，最终落荒而逃。而薯太郎将灵土矿石的封印修复完毕后，也带着希阳和基洛逃出了生命之源。延羽众人经历这一趟沙漠之旅后，不仅保护了灵土矿石，还得到了无双龙神，以及与薯太郎成为了好朋友。
告别薯太郎后，延羽众人回到了沙砾市，此时方知凌义的哥哥凌浩竟是邪灵组织的人。为了帮助凌义寻找回复凌浩记忆的方法，延羽众人各出奇谋，可是最终一无所获，反而导致笑料百出。虽然未能找到恢复记忆的方法，但在过程中，凌义感受到同伴支持他的力量，倍感安慰。然而安稳的日子并不长久，延羽众人发现了沙砾市农作物的异状，决定前去查探清楚。而那边厢，毕胜已经通过生命之源内的线索，得到了地底能源分布图，一个巨大的阴谋正在酝酿之中……
《机甲兽神第2部》剧情介绍：第35集
延羽一行人兵分两路，前去查清沙砾市的异状。当延羽和嘉静来到了香蕉园进行探查时，却发现香蕉竟全部变苦，延羽为此大雷霆，誓要查出罪魁祸首！凭着对香蕉的熟悉，延羽找到了令香蕉变苦的原因，竟然是邪灵组织在背后搞鬼。延羽怒不可遏，当即召唤无双龙神与盾甲铁刺激战。而面对力量超强的无双龙神，铁拿亦不禁颤抖。
那边厢，凌义三人到达小镇，受到当地镇民的热烈欢迎。凌义几人以为小镇一切如常，放松警惕之际，竟然突然晕倒了。原来镇长为了保住小镇，答应帮邪灵组织抓住凌义几人，于是在凌义几人的饭菜中下药。当镇长将晕倒的凌义三人押到凌浩面前时，凌义和基洛却突然醒来。原来凌义两人早已识穿了镇长的阴谋，假装晕倒。兄弟两人再次对战，凌义仍然迟疑不决，久久不肯召出机甲迎战，基洛见状只得独自苦斗。当嗜血天蝎死死钳制住赤焰战虎，要将基洛置诸死地之际，凌义再也忍不住，召唤出了啸海帝鳄……
《机甲兽神第2部》剧情介绍：第36集寻找金刚石
基洛为了保护凌义，不惜牺牲了赤焰战虎。面对受伤的基洛，凌义终于醒悟，决心追上凌浩将他打败，不料此时毕胜突然出现将凌义击至机甲消失。正当凌义以为自己必死无疑之际，毕胜竟然手下留情，并与凌义进行了一场交易……另边厢，延羽与嘉静正对战铁拿。因为无双龙神的力量过于强大，延羽无法完全驾驭，在战斗的过程中失控撞上了飞翼武者，令嘉静受伤，铁拿也趁机逃跑了，延羽为此愧疚不已。
经过酋长的分析，众人终于得知邪灵组织正在吸取沙砾市地底的灵土矿石能源。为了阻止邪灵组织的阴谋，延羽众人志气高昂地出发前去寻找灵土矿石的核心——金刚石，但唯独凌义却显得忧心忡忡，心中似有烦恼……在酋长的带领下，众人终于寻到了金刚石，正在此时，邪灵组织却突然杀出。嘉静等人召出机甲抵挡铁拿和凌浩，延羽、凌义则保护金刚石和酋长逃往森林。正当延羽以为安全之际，万万没有料到，凌义竟然突然叛变，夺走了金刚石。延羽气愤不已，召出无双龙神阻拦凌义，两人激战之下，无双龙神再次暴走了！！！《机甲兽神第2部》剧情介绍：第37集邪恶交易
当嘉静三人赶到之时，凌义已夺走了金刚石，树林中只剩下晕倒的延羽和酋长。原来毕胜与凌义做了交易，只要帮邪灵得到金刚石，他就会恢复凌浩的记忆，于是凌义决定将金刚石交给毕胜。但是凌义为了救出凌浩，不惜背叛朋友，到头却换来凌浩的冷淡与残酷。当凌浩要将凌义置于死地的时候，凌义的心中痛苦不已……而凭着金刚石的力量，灵土矿石聚集的计划进行得非常顺利，毕胜不禁大喜。此时，一直不肯就范的凌义，突然答应加入邪灵组织，而条件竟是要亲眼看见灵土矿石！
那边厢，延羽众人为凌义的叛变而愤慨，一时间陷入了低谷。为了不再让失控的事件重演，延羽决心控制好无双龙神。在嘉静三人的帮助下，延羽进行了艰苦的特训。最后，凭着延羽坚定的决心和不懈的努力，终于通过了所有训练，并完全控制住了无双龙神。与此同时，随着吸收装置不断吸收土地中的灵土矿石能量，沙砾市突然一阵地动山摇，延羽众人深知时间无多，必须尽快阻止邪灵组织的阴谋！
《机甲兽神第2部》剧情介绍：第38集奋不顾身
凌义面对眼前正在吸收能量的装置，突然召唤出啸海帝鳄，欲将装置毁掉。此时方知道，原来凌义是假装投靠邪灵组织，其目的是查处吸收装置的所在，并与延羽众人内外合击，摧毁邪灵的阴谋。毕胜暴怒，命令凌浩将凌义杀死。面对凌浩的致命攻击，凌义苦苦迎战。
与此同时，延羽众人靠凌义发送的信号，追踪到实验中心的位置。不料在途中遇到了毕胜和铁拿的阻击。延羽和基洛留下抵抗敌人，让嘉静、希阳火速赶往中心支援凌义，破坏吸收装置。毕胜深知无双龙神的厉害，竟然与铁拿使计先将无双龙神围困。基洛见延羽身陷险境，竟奋不顾身上前挡下全部攻击。赤焰战虎亦因此爆破、碎裂，彻底消失……
那边厢，凌义与凌浩激战，不堪重击之下，啸海帝鳄能量竟全数耗尽，再也不能战斗。而嘉静、希阳承受着凌浩的不断猛攻，两人危在旦夕。一旁的凌义只能眼白白地看着两人承受攻击，却无能为力，不禁心急如焚！
《机甲兽神第2部》剧情介绍：第39集未知的对手
啸海帝鳄能量耗尽，飞翼武者和象影神兵又消失了，嗜血天蝎似乎已经赢定了。正当凌浩要将嘉静和希阳了结之际，凌义突然爆发出水元素能量，啸海帝鳄竟再次复活，且升级成为了圣光神鳄。为了保护同伴，以及拯救沙砾市，凌义选择了大义灭亲，决心打败凌浩。最终，凌义驾驶圣光神鳄，将嗜血天蝎和吸收装置一并毁灭了，阻止了沙砾市的危机。那边，基洛为了救延羽而牺牲了赤焰战虎，延羽悲愤不已！对战之际，无双龙神渐不敌地狱猎豚，眼见无双龙神即将从基洛身上碾压而过，为了保护基洛，延羽终于使出了暴龙怒吼，将毕胜打败！至此，沙砾市终于恢复和平，灵土矿石再次沉睡于地底……与此同时，邪灵组织内部，最强的机甲——末日战神竟然被一个神秘人偷走了！
得知延博士几人失踪的消息，延羽众人决定告别酋长返回金波城，途中，延羽几人突然受到袭击，此时方见赫然出现在众人面前的是一辆从未见过的新型机甲，而更令人惊讶的是，与这辆新型机甲战斗的竟是铁角犀骑！！！《机甲兽神第2部》剧情介绍：第40集灵狮化石
延羽一众人启程返回故乡金波城，途中遇到受到邪灵组织攻击的少年向荣。眼见少年驾驶的末日战神渐不敌邪恶的铁角犀骑，延羽五人出手相助救下向荣，不料向荣却在战斗中趁机逃掉。
延羽五人进入金波城，这时发现基洛因为失去机甲一事暗自伤神，延羽、希阳为帮基洛修复基因手镯闹至笑话百出。同时一众人亦决定兵分两路，前去寻找延博士、林木博士的下落。
延羽、希阳二人回到家中，希望发现一些关于延博士的线索，却发现家里被人入侵，此人竟是被延羽一众人救下的向荣！在一场打闹之下，延羽、希阳发现向荣虽然驾驶着强大的末日战神却无意与他们为敌！与此同时，嘉静、凌义、基洛三人来到林木的研究所，却发现入口已被邪灵毁坏。几人在凌义的指示之下由另一条路进入研究所，不料误中林木设下的陷阱。原来林木早已被邪灵组织捉走，危急之下设下陷阱是为了通知嘉静一众人，邪灵组织为了研制出最强的机甲正在寻找一块灵狮的古化石！
《机甲兽神第2部》剧情介绍：第41集黄金圣杯
延羽根据向荣爱吃香蕉的特点在香蕉发布会现场发现了向荣，二人为争夺最后一把香蕉大打出手之时，罗煞已发现向荣的下落追踪而来。危险之际，向荣召唤出末日战神与延羽、希阳二人合力解救了发布会的群众。
延羽、嘉静五人再次汇合，得知两位博士失踪与化石情况。且在众人的威逼之下，向荣道出两位博士被邪灵所捉，是因为邪灵要找出金波城的能源石——黄金圣杯的消息。一众人为了阻止邪灵行动，决定再次兵分两路。
嘉静、凌义、基洛三人根据林木的指示前往化石开采基地，无意中开启了开采机械人罗密欧的开关。三人千方百计得到罗密欧的认可，并在罗密欧的带领之下，发现了灵狮化石的位置！
而另一边，延羽、希阳、向荣为了寻找黄金圣杯的下落决定去拜会延、林博士的老师达尔文。就在三人迷失在一个偏僻的小乡村之时遇到了一个和蔼的老伯，却不知这个极度厌恶机械的老伯打起了几人手中召唤器的主意。
《机甲兽神第2部》分集剧情介绍：第42集烈火灵狮
嘉静、凌义、基洛在罗密欧的指示之下挖掘灵狮化石，眼见即将成功之际，却被邪灵组织追踪到下落，受到怒海兽神的猛烈攻击！危急之下，凌义、嘉静召唤出啸海帝鳄、飞翼武者挡下攻击。就在凌义、嘉静不敌之际，基洛终于得到灵狮化石，且利用召唤器的力量召唤出全新的机甲烈火灵狮！在与怒海兽神的混战当中，凌义、基洛不慎跌落山崖！
与此同时，延羽、希阳、向荣三人受到老伯的热情招待，却不料老伯趁着三人松懈熟睡之际偷走了三人的召唤器，并将三人捉住，丢到了原始森林之中。原来老伯正是延羽一众人所寻找的达尔文。达尔文因为心爱的宠物小鸡被高科技产品害死，从此憎恨所有的机械产品。延羽、希阳、向荣丛林逃生闹至笑话百出，却在这一番吵闹之中渐渐了解到向荣的过去，发现向荣对邪灵有着强烈的执念。
那边厢，嘉静在罗密欧的帮助之下找到了坠崖的凌义、基洛二人，但是烈火灵狮却因为种种原因仍未能被召唤出来。三人决定尽快回去跟延羽几人汇合。《机甲兽神第2部》剧情介绍：第43集以身犯险
那边厢，嘉静在罗密欧的帮助之下找到了坠崖的凌义、基洛二人，但是烈火灵狮却因为种种原因仍未能被召唤出来。三人决定尽快回去跟延羽几人汇合。
达尔文偷走延羽三人的召唤器，却被罗煞根据召唤器上的追踪器追踪而至。眼见达尔文被邪灵追逐，身陷险境之际，终于走出丛林的延羽三人及时出现，挡下罗煞的攻击。战斗之中，延羽以身犯险引开罗煞注意，让向荣趁机使出招式击退罗煞，令向荣深受感动。同时，延羽三人也因为不顾一切救下达尔文及众村民一事感化了达尔文。
为了避开四周搜索几人的罗煞，达尔文想出利用召唤器上的追踪器引开邪灵组织追捕的小计谋。顺利摆脱邪灵之后，一众人朝着林木的研究所前进。
与此同时，嘉静、基洛、凌义、罗密欧四人已到达林木研究所外，却在此时受到雷神的伏击，凌义、嘉静召唤出机甲挡下，让基洛尽快进入研究所内，时却遭到中途杀出的罗煞的阻拦！危险之际，延羽、希阳、向荣三人赶到，救下了一众人，并让嘉静带着达尔文、基洛、罗密欧三人进入研究所加紧时间研发烈火灵狮！此时雷神亦发现了嘉静一众人的动向，决定将研究所的动力装置毁掉，凌义、希阳紧追而去！
《机甲兽神第2部》剧情介绍：第44集反败为胜
嘉静带领着达尔文、基洛、罗密欧进入研究中心，眼看灵狮化石即将被研制成基因手镯，这时却发现电源严重不稳，嘉静见状立刻前往一探究竟，罗密欧紧追而至。
研究所外，凌义、希阳死挡着欲破坏能源装置的怒海兽神，却被怒海兽神撞到能源装置上并将电源切断了。赶至的嘉静见状欲将电源重新接驳回去，不料在怒海兽神的猛攻之下，竟将嘉静困住无法动弹，一旁的机械人罗密欧见状，竟不顾危险，利用自己的机械物质将两条电源重新联接到一起，电源被重新启动，罗密欧却也因此牺牲！
因罗密欧的牺牲而深受打击的基洛，在达尔文的鼓励之下，带着研制成功的烈火灵狮前去救助渐不敌的凌义一众人，在一众人的合力之下，终于将怒海兽神击退！另一边苦战罗煞的延羽、向荣二人，在罗煞的疯狂攻击之下，延羽、向荣凭着自己对机甲的信任，终于反败为胜，将罗煞击退。
与此同时，邪灵组织从延、林博士口中套不到任何关于‘黄金圣杯’的线索，设下了对二人不利的计谋。
《机甲兽神第2部》剧情简介：第45集真挚的友谊
邪灵利用毒药般的饭菜对付延、林博士二人，却让二人趁机得到一通讯仪器。两博士利用通讯器改造而成的发射器不断向外界发出信号，试图通知延羽一众人自己的位置。
与此同时，达尔文向延羽五人道出金波城已无能源石‘黄金圣杯’的秘密，众人深感救父无望之时，达尔文想起制造接收器可侦察延、林博士的求救信号。在达尔文研制仪器的这段时间内，延羽无意中发现向荣的心结，得知向荣与父亲的过去及与邪灵的恩怨。见一脸失落的向荣，延羽举行一场机甲之间的足球赛。不料比赛当中笑话百出，却也让延羽、向荣之间的友谊更进一步，并且缓解了一众五人大战前的紧张感。就在此时，仪器终于研制成功，信号直指空中堡垒！延羽一众人赶至邪灵的空中堡垒之下，却苦于无进入堡垒的途径。就在众人无计可施之时，向荣独自一人偷偷找出了邪灵的空中交通工具，却不料这一切被基洛看在眼里，基洛对于向荣的身份渐渐产生了怀疑。
《机甲兽神第2部》剧情简介：第46集真实身份
延羽一众七人利用飞行器偷偷潜进邪灵的空中堡垒，却不料巨大的空中堡垒内地形错踪复杂，一众人决定兵分三路，分头搜索延、林博士的下落。
基洛、凌义在搜寻的过程中，无意中进入了邪灵的资料室，却因此发现了向荣的真实身份！
与此同时，延羽、嘉静、向荣三人也终于找到了被困的延、林博士，就在一众人拼命逃出，以为终于得救之时，却不料自己早已被邪灵发现，将留守在飞行器中的希阳、达尔文捉住，要胁延羽几人束手就擒！眼见延羽几人即将被捉，凌义、基洛突然杀出，引起一片混乱，向荣更趁机救下了被困的希阳、达尔文！
经过一场苦战，延羽一众人终于突破了丛围，夺得飞行器准备撤退之时，却被罗煞千方百计阻拦，最后向荣以身犯险，用机甲挡住一众追赶的邪灵兵，令延羽一众人趁机逃跑！
不忍丢下向荣的延羽意欲返回救人，却被基洛告知向荣的真正身份竟然是邪灵统帅希特的儿子！
《机甲兽神第2部》剧情简介：第47集中枢计算机
延羽一众人终于救出延、林两博士，两博士得知金波城已没有能源石一事后，决定要先邪灵一步找出支撑着整个金波城运作的‘中枢计算机’。不料这一切被罗煞全部监听到！
期间，基洛一众人以为延羽仍为向荣一事谨谨于怀，却发现延羽根本毫不在意，原来延羽认定向荣不肯道出身份一定是有迫不得已的苦衷。
那边厢，罗煞得知金波城已无能源石之后，定下了邪恶的阴谋。不多时，邪灵组织中向荣突然受到袭击且被秘密转移，同时，末日战神亦被神秘人所偷！
正当延羽一众前往废弃研究所查找关于‘中枢计算机’的位置之时，突然受到末日战神的攻击。延羽几人召唤出机甲死挡，眼见末日战神渐不敌之际，希特突然带着雷神杀出，挡住了延羽让末日战神趁机脱身。却不料，末日战神突然一转态度，竟然将希特撞下山崖爆炸而死！与此同时，顺利进入废弃研究室的嘉静一众人却发现研究室内被安装了炸弹，随着一场大爆炸，所有的资料灰飞烟灭。
邪灵组织中，向荣于监视室中见父亲被杀！
《机甲兽神第2部》剧情简介：第48集合体机甲
记载着‘中枢计算机’位置的研究所被毁，一众人为毫无线索苦恼之时，达尔文拿出爆炸中抢救回来的一个破损的小闹钟，并道出闹钟中记载的信息可以找到‘中枢计算机’的位置。在闹钟修理期间，凌义无意中从三位博士的口中得知，能打败强大的末日战神的只有合体机甲！
而此时，邪灵组织之中，罗煞正式成为邪灵的统帅，并且已经得到了‘中枢计算机’所在的中枢塔位置！罗煞更找到了巴比、杰克、罗斯帮忙，且罗煞更对向荣声称希特为延羽众人所杀，向荣亦正式加入邪灵大军。罗煞带着邪灵兵团气势汹汹朝着中枢塔前进！延羽众人在得知中枢塔位置之后亦立刻出发，却在接近中枢塔时被杰克、罗斯阻拦。众人兵分两路，基洛、嘉静、希阳[转自影视剧情频道]拦下杰克二人，令延羽、凌义赶去阻止意欲破坏中枢塔防护罩的罗煞众人。
面对强大的末日战神、铁角犀骑、独角恶灵，延羽、凌义渐不敌之际，凌义牺牲了自己的圣光神鳄，令延羽的无双龙神进化成为合体机甲，凌义却也因此跌落海中消失无影踪。
《机甲兽神第2部》剧情简介：第49集调虎离山
面对强大的邪灵机甲，延羽一众人被逼撤退。再次与三位博士会合，却被告知因为合体机甲的合成不但令圣光神鳄消失，凌义恐怕也已遇险。一众人伤心不已，延羽更意欲偷偷前去袭击邪灵，却被嘉静、基洛、希阳三人阻止！面对着即使机甲消失也死不退让的三人，延羽明白同伴不想失去自己的苦心，四人也在打斗中更加坚定了齐心合力、共同战斗的决心！
与此同时，被邪灵组织占据的中枢塔内，罗煞利用‘中枢计算机’靠冷却系统运行的原理，发现真正的‘中枢计算机’竟隐藏在地底下，并令杰克将联接‘中枢计算机’的通道打通！不料，向荣将一切看在眼中，竟悄悄对杰克所驾驶的火钻钢马做了手脚，并且，向荣跟踪着罗煞，发现了被困的雷神！
如果保护不了‘中枢计算机’，将其毁掉也不能落到邪灵组织手中，得到最后指示的延羽一众人再次朝着中枢塔出发！一众人实行调虎离山这计，嘉静、希阳、基洛将把守在塔外的巴比、罗斯、向荣三人引开，让延羽趁机潜进中枢塔中！
《机甲兽神第2部》剧情简介：第50集黑暗降临
嘉静、希阳、基洛设计将巴比、罗斯、向荣三人引走，却被向荣发现延羽已进入中枢塔！
同时中枢塔内，眼见一条人工通道即将被火钻钢马打通，延羽召唤出合体机甲欲阻止，却不料罗煞突然杀出，挡下了合体机甲！正当延羽、罗煞苦战之际，向荣突然出现，并将延羽不断往出口推去。原来向荣已偷偷地在火钻钢马身上装上了炸弹，一旦炸弹被引爆，整个中枢塔将被炸毁！却不料，罗煞早就看透了向荣的行动，炸弹一早就被销毁！眼见‘中枢计算机’即将落到邪灵手中，向荣不顾一切挡下罗煞，令延羽尽快进入中枢研究中心！
研究中心内，延羽及时出现，将意欲逆转‘中枢计算机’能量的火钻钢马击倒，却不料罗煞已将向荣打倒，趁机进入中心内，‘中枢计算机’能量被逆转，世界开始被机械化！
与此同时，面对强大的巴比、罗斯，嘉静三人不敌，被巴比二人进入中枢塔与罗煞汇合！
那边厢，雷神于海边救下了昏迷不醒的凌义，而达尔文三位博士正加紧时间复制消失的圣光神鳄！
《机甲兽神第2部》剧情简介：第51集末日战神的毁灭
因为‘中枢计算机’能量被逆转，眼见大家的努力将被白费，愤怒的延羽驾驶着合力机甲对罗煞进行疯狂攻击，就在此时巴比、罗斯突然杀出，挡到了罗煞面前。却想不到罗煞为了增强末日战神的能量竟将巴比、罗斯二人的机甲吞噬！面对如此强大的末日战神，嘉静、基洛欲限制其行动，却反被控制着对付延羽！而此时，昏睡中的凌义感应到了同伴的呼唤，慢慢清醒过来。凌义从三位博士口中得到延羽一众人身陷险境，立刻带着圣光神鳄前去救助！
这边厢，延羽面对着被控制的嘉静、基洛死不还手，眼见延羽渐危险之际，凌义驾驶着圣光神鳄出现，救下了一众人并道出了对付末日战神的方法就是利用机甲的元素能量！经过一场苦战，众人利用自己的机甲一一抵销末日战神体内的各种元素能量，在延羽的最后一击之下，末日战神在眼前被彻底粉碎！
与此同时，达尔文三位博士亦成功进入了中枢塔的控制室，设法停止被逆转的‘中枢计算机’！
《机甲兽神第2部》剧情简介：第52集最后的战役（大结局）
末日战神终于被击败，延羽一众人欢喜不已，以为一切将恢复原状之时，却发现‘中枢计算机’并未被停止，源源不断的机械能量侵袭整个世界，无数动、植物被逐渐机械化，四处破坏，五大城市秩序大乱！
无计可施的延羽众人收到博士们的指示，能停止‘中枢计算机’的唯一办法竟然是含有陨石能量的机甲召唤器！经过一番痛苦挣扎，五人终于明白机甲兽神最终的使命是守护这个世界，五人决定忍痛挥别机甲！
五人最后一次召唤出机甲，同时撞向‘中枢计算机’，却不料力量仍不够，眼看即将被‘中枢计算机’能量反吞噬之际，向荣突然出现，并将末日战神召唤出来！集合着六辆机甲的力量终于将‘中枢计算机’毁掉！
机械化能量渐渐消散，世界再次恢复原貌。
延羽六人各自回到了自己的家乡过上了和平安定的生活。就在此时，嘉静、凌义、希阳、基洛四人突然收到了延羽的紧急集合通知，原来是延博士发明了一系列机甲模型，机甲兽神将再次陪伴在延羽六人身边！
第二部大结局
