我们眼尖的加藤姐姐瞅见了路过的朝田，于是两人很快blahblah的开始聊天讨论手术，加藤姐姐更是很开心地要朝田在手术中加油……
伊集院同学再度被忽略在背景中……
于是在受到了黑木的召唤后，伊集院毅然选择了黑木队。
日剧《医龙3》分集介绍：第5集剧情
因为就救下了欲跳楼的患者，朝田被运送往急救室。心脏瓣膜损伤，心脏血液逆流……但是，加藤在为重症患者手术，而心脏外科的医生没有谁能出来做这个手术。黑木听到了这个消息，对伊集院说去吧。伊集院向急救室飞奔……如果不马上进行手术，心脏将再度进一步损伤，朝田濒临死亡。貌似藤吉要伊集院为之做手术。但是，伊集院却说“我办不到，我已经不是医龙队里的一员了。”于是，藤吉说：“朝田为了你能回归的那一刻，打磨了你的持针器，他到现在仍一直把你当做医龙队的一员。”也正是藤吉的这一番话，坚定了伊集院的心。“无论如何都要救回朝田”！…………于是医龙团队大家一起为朝田做手术，伊集院作为主刀医，开始手术……
朝田的命运到底如何呢？这么高难度的手术伊集院能做成功吗？手术过程中还会遇到什么样的问题？
日剧《医龙3》分集介绍：第6集剧情
朝田龙太郎发现小男孩真锅彻要跳楼，连忙一路狂奔上天台阻止，没想到人救到了，自己却从15楼直坠而下，心脏二尖瓣、三尖瓣腱索断裂，眼见丧命在即，加藤晶又正在处理别台手术、无法分身，伊集院在藤吉的苦劝下，想到以前朝田的教悔，决定硬着头皮主刀，即使旁边的大多数人都不看好他的技术....
尽管实际情况比想像更恶劣，伊集院还是顺利先完成二尖瓣的修复，正要进行下一步时，对他没有信转载注明：电视剧频道心的校长鬼头笙子赶来阻止：“你做不了瓣形成，如果因处理不当让他死了，你要怎么负责？”当所有人犹豫时，加藤跟麻醉师荒濑总算赶了过来，但是加藤决定相信伊集院，让他继续主刀，无视鬼头的命令：“这个团队的负责人是我，我会承担一切责任！”，随后伊集院不负众望，再度完成这个超高难度的手术；走出手术室时，伊集院得到同伴的鼓励跟赞赏，想起刚刚经历的事，心有余悸的他这时才发现腿都软了。 经过这次事件，伊集院决定向黑木庆次郎请辞，重新回到心脏外科，因为他想重新相信一次“团队”。
黑木庆次郎的过往在藤吉口中娓娓道来，15年前一件医疗事故让当时身为第一助手的他背了黑锅，而且死者还是最相信他的未婚妻，让他从此对心脏外科深恶痛绝，更对所谓“团队”嗤之以鼻，所以他放弃了外科，改而转攻心导管介入手术....
因为手术成功，所以鬼头并没有处罚违抗命令的加藤，只是口头警告她，但随后说了一句意味深远的话：“他要是不能做手术，也就是一个普通病人”，如果朝田的意识不能恢愎，那他就没有任何价值可言了，这正是经营者的态度。三天后，加护病房的朝田还在持续昏迷状态，鬼头决定停止心脏外科所有手术，没想到医龙队重新聚首，再度拒绝了命令，因为他们有信心继续工作，而且相信朝田一定会顺利醒过来。朝田醒来的消息让团队兴奋不已，但是命运从来爱开玩笑，因为朝田失忆了，他竟然连“手术”也忘了是什么.....
日剧《医龙3》分集介绍：第7集剧情
朝田的脑部深蛋白质轻度受损，导致记忆丧失，估计三个星期内才会慢慢恢愎；此时医院刚接下一位病人，怀孕34周的佐藤理惠有系统性狼疮，导致胎儿有先天性房室传导阻滞，当脱离母体时就会因心跳减弱死亡，所以必需在剖腹产二分钟之内帮胎儿植入心脏起搏器，
这场大手术预定在三周后实行，到时候需要小儿科、妇产科、心脏外科、护士的齐心协力才能完成。
当加藤晶看到病历表不禁一楞，因为理惠的丈夫佐藤修一正是她九年前的未婚夫，只是当时的她选择了事业、放弃了婚姻，不同的是理惠一结婚就选择了家庭，放弃了工作，刚好是两种完全相反的选择，正是因为知道加藤在美国专攻“小儿心脏科”，所以佐藤才会来明真医院向她求助。
真锅彻因为自己连累了朝田前来病房道歉，意外让朝田提前恢愎了记忆，让众人又惊又喜，只是如今衰弱的他还没有体力动手术；白天的失败模拟手术过程，加上预定的手术必须提前到明天，朝田势必不能加入，这些事情都一再让加藤心浮气躁，此时的她却看见半夜里，朝田一个人在走道上，跌倒又再爬起，一步一步辛苦的练习着走路. ....
下午一点，手术开始，这次顺利在二分钟内完成预定手术，却没想到胎儿出现中毒的迹象，原来胎儿身上转载注明：电视剧频道还有动脉导管闭合异常的问题，但是因为刚出生的胎儿不能使用人工心肺，所以正常的主动脉重建会有困难，加藤一时也束手无策，这时朝田赶来提醒可以使用锁骨下动脉瓣动脉成形术“Blalock-Park”，回过神来的加藤有了更好的想法，她决定用另一种更适合现况的“Subclavian flap ”，成功完成了二次手术，救回胎儿的性命，主动脉重建手术宣布成功！
校长室的鬼头收到了一个国外寄来的盒子，里面装的是一大套俄罗斯的玩偶，上面画的人物肖像赫然就是野口，里面还藏了一张纸条：“我会回来的！” ；当病床上的朝田拿起手术的尖嘴夹正要练习时，才发现致命的危机，自己的右手竟然酸弱无力.........
日剧《医龙3》分集介绍：第8集剧情
朝田右手持手术刀会发抖，经过双叶大学脑神经外科检查结果是“PTSD /创伤后压力症候群”，简单说这是一种经过重大挫折后产生的心理创伤，心病只有心药医，没有任何其它方法可以治疗；
原来八年前，朝田曾经在非洲战地MSAP 难民营，因为救治一位误踩地雷的小孩，背部受了重伤昏倒，结果因无法操刀导致小孩死在眼前，那一幕影像在他心里重重留下阴影，他把内疚埋藏在心底，只是如今无预兆的爆发出来.....
真锅彻最佳的治疗方案是等待心脏移植，但是因为并发症- 扩张型心肌症(DCM) 提前发作，让他的情况再度恶化，缓解的方案是实行“乳头肌拉近手术”，
朝田几经进行手术模拟还是无法克服发抖的问题，只好在开刀的前一天低头道歉，承认自己还没恢愎，改由加藤晶担任主刀，伊集院担任第一助手，而朝田本人则担任第二助手。尽管手术过程中朝田一度恍神，加藤的手术仍然非常成功，不料就快要完成时，肾上腺素输管被粗心大意的实习医生撞掉，导致还没缝合的真锅彻血压降低、心跳顿时停止，而重启人工心肺需要的时间根本来不及重来一次，最后加藤也只能无奈的听天由命，朝田想到手术前医龙队同伴跟小彻曾经对他说过的话，右手停止了发抖，他不顾加藤众人的质疑，决定在左心房直接开刀，用“重叠法”进行“左心室成形术”，当麻醉医问他有没有把握时，朝田：“有这个团队在就行，我可是朝田龙太郎！”，他果然用超快的速度，在一个血液循环内完成手术救回了小彻。
黑木庆次郎在亡妻的坟上拜祭，巧遇了藤吉圭介，说起了15年前的事故，藤吉劝他把心思放在未来，而不要老是纠结在过去，这样才对的起死去的人，当藤吉离开时，却没有看见黑木庆次郎嘴巴流下的鲜血.....
这一天要结束时，明真医院来了不速之客，野口戴着毛帽，拖着行李出现在医院大厅，形态从容的他用俄语说出：“好久不见”，宣告他正式归来！
日剧《医龙3》全集大结局：第9集剧情
黑木庆次郎隐瞒了自己的病情，在一次介入手术执行过程精神不集中，导致病人上行主动脉瘤破裂，性命危在旦夕，不承认出错的他愣在当场，却完全不想找心脏外科的人帮忙，没想到藤吉早一步看见情况不对，紧急请了医龙队前来支援，结果朝田一边进行主动脉置换术，一边同时要求黑木进行主动脉瘤腔内修复，两个人第一次协力合作，共同救回了病人。
高濑清是黑木15年前港北医院的同事兼好朋友，更曾经是他相信的医疗团队一员，只是团队最后共同背叛了黑木，让他背上未婚妻医疗事故的黑锅，如今高濑找上门请求帮忙治疗妻子春香的心脏病，本想拒绝的他在朝田影响下，放下了成见，亲自向朝田要求协助；
不久后黑木在双叶中央医院的病历表被伊集院发现..... 患有白血病的黑木病情发作，终于不支昏倒。
从俄罗斯归来的野口带回新计画“医疗特区推进原案”并没有得到鬼头笙子的认同，只是她没想到这只是简单的试探；董事会议上，野口提出了紧急动议，事先串连了所有理事的他，取而代之当上了新校长！ ( 应该是院长吧？ )，让鬼头在完全措手不及的情况下黯然退场.....
第一个俄罗斯病人莉迪亚即将来日本进行“医疗旅游”，她是世界级的钢琴家，预定12月10日在明真医院进行“三瓣膜手术”，正好跟高濑春香的“主动脉弓基底部置换术”同一天，加藤晶反应人手根本不够，而朝田却早有了打算，他找回了以前的北洋医院同事外山诚二、野村博人帮忙。 ( 医龙2的角色 )
日剧《医龙3》全集大结局：第10集（医龙3大结局）
黑木庆次郎因为白血病发作，昏倒在医院被荒濑发现，清醒过来时才对朝田坦白承认已是无可治疗的末期，他现在现在最大的希望就是朝田能尽全力帮助高濑春香，这也让新任校长野口发怒，因为俄国钢琴家莉迪亚身份更为尊贵，可惜朝田不给面子，坚持两边都是同样重要的病人，不会因此偏心任何一方。
手术分两边进行，第一手术室由朝田、伊集院、北川响、荒濑负责治疗高濑春香，进行“主动脉根部置换术”及“全主动脉弓换置术”；第二手术室由加藤晶及北洋医院的外山、野村负责莉迪亚，进行自体瓣膜的“三瓣膜修复术”。第二手术室第一助手外山使用了激烈的方法来去除钙化的部份，引起骚动，还好胸有成竹的他很快完成了“主动脉瓣”的修复，两台手术都进行顺利的此时，外面却传来另一个消息，春香的女儿高濑惠赶来医院送亲手织的围巾，因为激烈动作导致“肺栓塞”，即血块阻塞了肺动脉！而进行血栓摘除需要“人工心肺机”，问题是医院内的两台人工心肺机都正在使用中，即使想从别的医院调用，时间也赶不上！
由于春香正处于低温循环的假死状态，可以空出30分钟的人工心肺机，朝田立即要求伊集院在30分钟内完成血栓摘除，没想到当伊集院刚接手，高濑惠就心跳停止，电击、心脏按摩却没有发生作用，此时黑木闯了进来，体力不佳、一边发抖的他用“心肺辅助法”帮忙插入导管，总算连接上了机器、恢愎了心跳，接着在倒数10分钟时伊集院完成了右肺动脉的血栓摘除，这才发现血栓竟然已经蔓延到了左肺动脉，问题回到起点，人工心肺机只有一台，是救母亲还是女儿？
朝田果断想采取“双重循环”，关掉心肺机一个子泵作为另一个人的主泵使用，就可以暂时实现两个人的体外循环，但这是不合法的医疗行为，手术室内的所有人可能都会面临吊销执照，时日不多的黑木决定担下所有责任，这时又面临另一个问题，这种心肺机的使用方法第一手术室的临床工学技师不会，而第二手术室的野村分不开身，
黑木连忙拉了在外面等候的高濑进来，没想到却被野口阻止，因为这会导致明真医院成为医疗特区的污点，鬼头现身挡住了压力，答应保密做为交换条件。宝刀未老的高濑不负所托，第一手术室的母女两人都顺利完成手术，第二手术室也同时宣布成功。
手术完成却不见黑木踪影，朝田找到再次昏倒在地的他，黑木：“让我加入这个团队吧”，朝田：“说什么傻话，你早就是这个团队的一员，是我们的同伴！ ”，就见黑木在微笑中逝去......
尘埃落定，野口辞了明真医院校长一职，改行为“医疗评论家”，而北洋医院跟明真决定进行交流合作，互通人才有无，此时的朝田了无牵挂，趁着加藤、伊集院手术正忙时，悄悄离开，拜祭完黑木后，一个人走进夕阳荒野中......（大结局）
