《天之痕》既然是《轩辕剑三》的外传，故事完全发生在大家所熟悉的中国土地之上，是一部完完全全中国风之RPG。在游戏中，玩家将可看见许多自己熟悉的历史人物出现，并有历代的《轩辕剑》之角色，适度穿插于故事间。此外，感情戏也在这一次的故事之中担任了重要的比例，而且剧情上也延续了《轩辕剑》系列特有之上古神话色彩，及结合历史时代的特色，而游戏女主角小雪和男主角陈靖仇的更是演绎了一段凄美爱情故事。
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小雪简介：轩辕剑叁外传天之痕女主角一号，昵称小雪，自幼孤儿，由月河村客栈老板贺老伯扶养，有一弟弟。出身于北方贫穷破落小村中，满头白发被当地村人认为是不祥的像徵，备受歧视。后来她的村子被村人祭祀的“河神”所摧毁，村人把责任全部归咎于她，她因而被永远逐出了自己的故乡。在无依无靠之下，男主角陈靖仇邀她与自己一起旅行。 后在仙山岛仙人的帮助下得知自身乃十大上古神器之一的女娲石转世，并与阿仇成功修补了天之痕。游戏最后的两个结局，玉儿结局中小雪会为救活玉儿而变为原形——女娲石，而在小雪结局中则会与阿仇一起生活。
