B-1B的机组由正副飞行员、自卫系统操作手(defensive systems operator DSO)、攻击系统操作手(offensive systems operator OSO)四人组成。机上的自卫系统包括AIL系统公司的ALQ-161电子战系统，通过一个汉尼威尔公司(Honeywell)的多功能显示装置连接到攻击电子系统(Offensive Avionics System OAS)上。攻击系统则通过两个上述同型装置连接到攻击电子系统上。当前B-1B没有担负核战略威慑任务，但毫无疑问其具有强大的核战略打击能力。
B-1B具有完成战略任务的能力，但由于战术任务的需要，目前B-1B没有配备核武器。B-1B拥有三个纵列分布的弹舱和六个外挂点，所有弹舱最大内挂载重量34050千克，所有外挂点最大载重量26786千克，加起来高达60多吨。B-1B内挂主要武器为AGM-86B空射巡航导弹(AirLaunchCruiseMissileALCM)、AGM-69短距攻击导弹、JDAM联合直接攻击弹药(JointDirectAttackMunition)、227千克MK82、454千克MK83、908千克MK84普通炸弹、454千克的BLU-110子母弹箱和908千克的BLU-109子母弹箱、227千克MK36布雷装置、227千克MK62水雷。外挂点携带ALCM。ALCM是美空军战略巡航导弹，与“战斧”类似，采用涡扇动力，射程高达2500千米。JDAM射程达27千米，采用GPS制导，精度达到13米。
AGM-86B战略巡航导弹是美轰炸机当前的主要武器之一，携带常规战斗部，射程达2500千米。AGM-69短距攻击导弹采用核战斗部，但目前不列在挂载武器中。波音公司的JDAM联合直接攻击弹药采用GPS和惯性导航双重制导方式，战斗部采用包括454千克的MK-83、454千克的BLU-110、908千克的MK-84和908千克的BLU-109的装药部分构成。JDAM的射程达到27千米，命中精度在13米以内。
精良的武器需要先进的火控系统才能发挥作用。B-1B装备了先进的 诺斯罗普?格鲁曼公司 的APQ-164火控雷达。该雷达使用相位阵列天线，具有强大的地形跟踪能力和极高的扫描频率，工作模式多样化。这使得B-1B能够精确定位、完成气象探测，做地形回避、地形跟踪等低空突防动作。最终该雷达将捕捉到目标，引导B-1B的各种武器准确攻击。如此多的功能都集中在一个火控雷达上，可见其先进程度。
在B-1B的自卫系统中，AN/ALQ-161电子战系统起着核心作用，能够有效的干扰各种早期预警雷达和火控雷达。其内置程序安装在一部 IBM AP-101F微机内。AN/ALQ-161还包含了诺斯罗普?格鲁曼公司的干扰机、雷声公司的相位阵列天线和一个能监视尾部半球情况的告警雷达。该系统还控制着机上的箔条及红外诱饵发射器。美军计划在2007年前将把为 F/A-18 研制的AN/ALR-56雷达告警装置和IDECM(IntegratedDefensiveEletroniccounterMeasures，综合自卫电子对抗措施)添加到B-1B的电子战系统中。