国清寺不仅在国内佛教界为一宗之地，而且也是日本佛教天台宗的发源地。早在一千二百多年前，被日本人民称为“和上”“大和上”的鉴寘法师(688—763)，为了传播天台宗，六次东渡，终于成功。他从中国带出大量佛经、佛具、佛像、药物、工艺品及各种书画。鉴真圆寂之后，日本名僧最澄大师于唐贞元二十年(804)九月，.横渡至国清寺，回国时带回寺内赠予他的“天台宗”《法华经》128部，345卷，他在日本建造了一座国清寺(又名延历寺)。他自己也成了日本天台宗的祖师。最澄大师圆寂后，他的弟子圆证大师(814—891)来到国清寺，朝山求法，撰著了《天台宗疏》，达300卷之多，对发展佛教天台宗起了重要作用。
自此以后，宋元明清各代中日都有僧人互访，宋代天台宗第十七袓知礼法师名传海外，佛法精深，日本佛界曾特遣使者持二十问至，均得圆满答复，为此宋真宗赐知礼为“智大师”，并在景德二年(.1005)，将寺改为“景德国清寺”。解放以后，国清寺更为日本宗教界人士常访之地。
国清寺外，还有僧一行禅师之墓，墓在古木浓荫之下，墓旁有碑。一行禅师俗名張遂，河北巨鹿人，为中国佛教密宗之祖，而且在历数、天文方面颇有造诣。相传一行在编《大衍历》时，为解疑难，特去国清寺拜访达真法师。到寺之日，见寺门紧闭，只听见里面一长老说：“今日有弟从远方来求我算法，若门前溪水西流，弟子便到。”一行听罢，果见涧水回环西去，.遂感叹不巳。后人为纪念此事，在桥头立碑，上书行到此水西流”。赵朴初先生见景生情，吟诗赞曰：“森森万木寺门幽，热脑途中喜小休。忽见回天好身手，一行到此水西流。”