产生肌肉酸痛的原因主要为乳酸堆积和肌肉痉挛。
肌肉收缩是需要能量的，如果能量来自细胞内的有氧糖代谢，就是有氧运动；若能量来自无氧糖酵解，就是无氧运动。有氧运动时葡萄糖代谢后生成水和二氧化碳，可以通过呼吸很容易被排出体外，对人体无害。而无氧运动时葡萄糖酵解产生大量乳酸等中间代谢产物，不能通过呼吸排除，大部分由血液输送到肝脏，转变为肝糖原。当乳酸产生太多时，来不及转变，就形成了乳酸堆积。
剧烈运动到一定时间后，由于体内营养物质消耗过多，氧的供应不足，则通过无氧酵解来补充能量。平时缺乏锻炼的人，突然曾加运动量，更容易出现肌肉酸痛，是因为其组织中ATP的储存量更少，有氧供能能力更差。肌肉内形成的大量乳酸无法迅速运达肝脏转化为肝糖原，而在体内堆积，导致肌肉出现酸痛感．
发生肌肉酸痛时要与肌肉拉伤鉴别：
1、肌肉酸痛：无受伤史，酸痛在休息一段时间后发生，酸痛的范围较广泛，没有局限性的压痛点，经休息１－２天后酸痛明显减轻或消失。可以通过休息、牵拉、按摩等得到缓解。
2、肌肉拉伤：有受伤史，疼痛范围较小，最痛点在伤处，继续运动时疼痛加重，经休息１－２天后疼痛不消失甚至加重。必须通过医疗手段进行治疗。
肌肉酸痛是肌肉疲劳的具体象征。表现为：疲劳无力、肌肉酸痛、僵硬等感觉。
