中医认为花椒性温，有温中散寒、除湿、止痛、杀虫的作用，春季适度食用，有助于人体阳气的生发。同时，春季各种细菌病毒开始繁殖，是流行病的多发季节，而花椒中的挥发油可提高体内巨噬细胞的吞噬活性，进而可增强机体的免疫能力，并且花椒对白喉杆菌、肺炎双球菌、金黄色葡萄球菌和某些皮肤真菌有抑制作用。
此外，南方的春季雨水较多，脾胃虚弱的人非常容易受到湿邪的困扰，导致消化不良，而花椒具有温中除湿的作用，尤其是脾胃虚寒、食欲不振的朋友更应吃点花椒。而寒性痛经以及风寒湿性关节炎患者也适合多吃点花椒。而在烹调绿豆芽、白萝卜、冬瓜、莴苣、菠菜、芹菜、兔肉等凉性或寒性的蔬菜或肉类时，无论是在春季还是其他季节，最好都要加点温性的花椒。
炒菜时候可用花椒来炝锅，也可用花椒面来代替，做各种肉类、鱼类煲汤时，加入十几粒花椒更是不错的选择，因为花椒可以有效消除肉类的异味，如羊肉的膻味、鱼的腥味。
但花椒性热，容易上火的朋友应该少吃，孕妇多食会损伤胎气，哺乳期的妈妈更应少吃，因为花椒有回乳的作用，食用后容易导致断乳。