临床蛋白质组学
分類: 图书,医学,基础医学,
作者: 邱宗荫,尹一兵等编著
出 版 社: 科学出版社
出版时间: 2008-4-1字数:版次: 1页数: 463印刷时间:开本: 16开印次: 1纸张:I S B N : 9787030206268包装: 平装内容简介
本书详细阐述了临床蛋白质组学研究所必需的基本理论与策略,系统、全面、深入浅出地介绍了蛋白质组学在临床医学与药学领域中的应用及发展状况。全书分为15章,一~四章介绍临床蛋白质组学研究的基本理论与策略,蛋白质组分析的基础技术,液相色谱技术在蛋白质组分析中的应用.以及基于稳定同位素标记的定量蛋白质组学分析技术。五~十五章重点介绍蛋白质组学在临床医学领域中的应用及其最新进展,包括临床蛋白质组分析中的样品制备、MALDI-TOF-MS在临床蛋白质组学研究中的应用、血浆/血清蛋白质组学、血细胞蛋白质组学、唾液蛋白质组学、精液蛋白质组学、肿瘤蛋白质组学、疾病蛋白质组学、临床干细胞蛋白质组学、药物蛋白质组学及其临床应用等。
本书既是初学者开展临床蛋白质组学研究工作的入门向导,也可为从事医学、药学、蛋白质组学、生物化学、细胞生物学、分子生物学、分析化学和相关领域研究的人员提供参考,可用作高等院校相关专业本科高年级学生和研究生的教学参考书或教材。
目录
前言
第一章蛋白质组与临床蛋白质组学
1.1蛋白质组学的历史与发展
1.2蛋白质组与基因组的区别
1.3蛋白质组学的分析策略与分析方法
1.4临床蛋白质组学
参考文献
第二章蛋白质组分析的基础技术
2.1 双向电泳
2.2生物质谱技术与方法
2.3蛋白质组学中的生物信息学基础
参考文献
第三章 液相柱色谱技术在蛋白质组分离中的应用
3.1液相柱色谱分析的基本原理
3.2蛋白质的液相柱色谱分离模式
3.3离子交换色谱法与色谱聚焦
3.4基于疏水作用的液相柱色谱法
3.5亲和色谱法
3.6凝胶过滤色谱法
3.7多维液相色谱技术
参考文献
第四章基于稳定同位素标记的定量蛋白质组学技术
4.1体内标记
4.2体外标记
参考文献
第五章 临床蛋白质组分析中的样品制备
5.1 临床蛋白质组分析中样品制备的基本原则
5.2激光捕获显微切割技术
5.3细胞或组织样品的制备
5.4血清/血浆样品的制备
参考文献
第六章 MALDI-TOF-MS在临床蛋白质组学研究中的应用
6.1SELDI蛋白指纹图谱技术
6.2液体芯片飞行时间质谱技术
6.3 MALDI质谱成像技术
参考文献
第七章血浆/血清蛋白质组学
7.1 引言
7.2血浆/血清
7.3血浆/血清蛋白质组学的研究进展概述
7.4血浆/血清蛋白质组学的临床应用
7.5结语
参考文献
第八章血细胞蛋白质组学
8.1正常血细胞蛋白质组学
8.2异常血细胞蛋白质组学
参考文献
第九章唾液蛋白质组学
9.1 唾液蛋白组学的研究背景
9.2唾液蛋白质组学研究中样品的收集与处理
9.3 唾液蛋白质组学的研究策略与技术路线
9.4唾液蛋白质组学的研究进展
9.5展望
参考文献
第十章精液蛋白质组学
10.1 精液蛋白质组学的研究背景
10.2精液蛋白质组学研究中样品的收集与处理
10.3精液蛋白质组学的研究策略与技术路线
10.4精子蛋白质组学的研究进展
10.5精浆蛋白质组学的研究进展
10.6对精液蛋白质组学研究的展望
参考文献
第十一章临床肿瘤蛋白质组学
11.1 临床肿瘤蛋白质组学研究的目的
11.2 临床肿瘤蛋白质组学的研究策略和方法
11.3临床肿瘤蛋白质组学的研究进展
11.4问题与展望
参考文献
第十二章疾病蛋白质组学(一)
12.1疾病蛋白质组学:机遇与挑战
12.2心血管疾病蛋白质组学
12.3心血管系统的亚细胞蛋白质组学
12.4代谢性疾病(糖尿病)蛋白质组学
参考文献
第十三章疾病蛋白质组学(二)
13.1 消化系统疾病蛋白质组学
13.2感染性疾病相关的蛋白质组学研究
13.3妊娠的蛋白质组学
13.4神经系统疾病蛋白质组学
13.5泌尿生殖系统疾病的蛋白质组学
13.6耳鼻喉疾病的蛋白质组学
参考文献
第十四章 临床干细胞蛋白质组学
14.1干细胞生物学特性
14.2干细胞蛋白质组学的研究进展
14.3干细胞蛋白质组学在临床医学中的应用
参考文献
第十五章药物蛋白质组学及其临床应用
15.1药物作用靶点
15.2 与药物作用靶点研究有关的蛋白质组学技术
15.3 临床药物蛋白质组学与生物标志物
15.4 抗肿瘤药物多药耐药机制的蛋白质组学研究
15.5药物治疗学中的蛋白质组学研究
15.6蛋白质组学与中药现代化
参考文献
彩版
书摘插图
第二章蛋白质组分析的基础技术
双向电泳(two dimensional electrophresis,2-DE)是当前蛋白质组学研究中分辨率最高、信息量最大的分离技术。在比较蛋白质组学研究中,双向电泳还是不可缺少的手段。目前所应用的二维电泳体系是由0’Farrell等于l957年发明的,其原理是根据蛋白质的两个一级属性(等电点和分子质量),将一种蛋白质样品进行两次电泳,即:在第一个方向上按等电点高低进行分离,称为等电聚焦;在第二个方向(与第一次电泳成直角的方向)上按分子质量大小进行分离。
根据第一向等电聚焦条件和方式的不同,可将双向电泳分为三种系统:①ISO-DALT(isoelectric focusing followed by separation with respect to molecular mass expressed in dal—tons)系统。电泳在聚丙烯酰胺管胶中进行,载体两性电解质(carrier ampholytes)在外加
电场作用下形成pH梯度。该系统的缺点是pH梯度不稳定(如阴极漂移)、重复性差、上样量低,故不利于不同实验室之间进行图谱的比较和数据发布;②IPG—DALT系统。使用固相pH梯度(immobilized pH gradient,IPG)胶的等电聚焦系统。其pH梯度的形成依赖于不同pK的一类合成的化合物。这是目前蛋白质组学研究中用得最多的双向电泳体系;③非平衡pH梯度电泳(non—equilibrium pH gradient electrophoresis,NEPHGE)系统。蛋白质样品被加在pH 7~10或pH 3.5~l0的凝胶的酸性部分进行分离,电泳时间相对比较短。NEPHGE旨在克服平衡pH梯度电泳时的严重阴极漂移和碱性蛋白的丢失,但重复性比较差。
此外,第一相不采用等电聚焦方式的双向电泳有BN/SDS.PAGE双向电泳、对角线双向电泳等。
2.1.1 IPG-DALT双向电泳
2.1.1.1 IPG—DAl.T双向电泳的流程
IPG.DALT双向电泳的流程如图2.1所示。图中,A为使用IPG胶的等电聚焦过程,被分离的样品加在重泡胀的固相pH梯度胶条(immobilized pH gradient trip)上,通电后,样品中的蛋白质成分按照各自的等电点聚集在胶条上不同的pH梯度区,形成了不同的谱带,每个谱带中聚集了等电点相近的蛋白质成分。8为SDS.PAGE电泳的过程。第一向等电聚焦后的胶条在SDS和DTT中平衡后,贴在SDS.PAGE胶板的负极端进行电泳。
……