代谢组学—方法与应用

分類: 图书,自然科学,生物科学,生理学,
作者: 许国旺等著
出 版 社: 科学出版社
出版时间: 2008-8-1字数: 624000版次: 1页数: 421印刷时间: 2008/08/01开本: 16开印次: 1纸张: 胶版纸I S B N : 9787030215284包装: 平装内容简介
本书是国内第一部集基本理论和实际应用于一体的、极有价值的关于代谢组学的专著,对学科的发展现状、面临问题、应用前景、未来趋势和学科本身的价值都做了客观、科学的描述。除简要回顾代谢组学的发展历史、特点外,重点介绍了代谢组学技术平台及其在健康疾病、药物毒性、植物、微生物、营养科学和环境科学研究中的应用,使读者能在短时间内对最新的技术和国内外进展有一全面了解。为适应不同层次人员对代谢组学知识的需求,本书在全面阐述色谱、质谱、核磁共振谱和多变量数据分析方法在代谢组学中的应用的同时,图文并茂地剖析了代谢组学在不同领域内的应用,使读者能很容易地应用本书解决相关领域中的问题。
本书既可作为从事代谢组学研究的专业人员的参考书,也可作为相关领域研究生的教材。对代谢组学感兴趣或具备一定的生物化学和分析化学背景的读者也可根据自己所从事的专业有选择地阅读部分章节。
作者简介
许国旺,男,1963年生,浙江嵊县人。1984年毕业于浙江工业人学化工系,1991年在中国科学院大连化学物理研究所获博士学位,师从著名的色谱学家卢佩章院士。毕业后留所,在国家色谱研究分析中心工作。1995~1997年获马普(Max-Planck-Institute)研究基金资助,在德国Tuebingen大学做高级访问学者。回国后担任大连化学物理研究所研究员、博士生导师。2004年获国家杰出青年基金资助。现为大连化学物理研究所生物技术部生物分子高分辨分离分析课题组组长、代谢组学研究中心主任、中国色谱学会副理事长兼秘书长、中国化学会理事、国家烟草局科学技术委员会成员。 许国旺研究员一直从事色谱及其联用技术的基础理论及应用研究。根据样品对象的复杂性,在方法学上,走过了从经典一维色谱到中心切割多维色谱,再到全二维色谱的研究过程,逐渐形成了以“多维色谱+联用技术+化学信息学”的科研特色;在研究对象上,从石化、环保领域逐渐实现了向生命科学(药物、代谢组学、生物催化)领域的转化。从1996年起开展“健康和代谢的关系”研究,并逐步进入代谢组学领域,将研究方向集中到代谢组学的技术平台和其在重大疾病的生物标志物发现、中药疗效毒性和作用机理研究等,其中基于尿中核苷代谢诊断肿瘤的项目已通过中国科学院组织的鉴定。许国旺是我国最早进行代谢组学研究的学者之一。
至今,许国旺已出版专著4部,在国内外杂志发表论文270多篇。申请专利32项(其中已授权14项),鉴定成果7项。在相关领域形成了一定的影响,并得到国际同行的认可。他是J.Chromatogr.B主编(editor),Metabolomics、J.Pharmaceut.Biomed、Chromatographia、J.Sep.Sci.等10多种杂志编委及国际高效液相色谱会议永久性科学委员会委员,第30届国际毛细管色谱会议和第33届国际高效液相色谱会议副主席。
目录
序
前言
第1章绪论
1.1代谢组学简介
1.2代谢组学的研究方法
1.3代谢组学的应用
1.4代谢组学发展展望
参考文献
第2章气相色谱-质谱技术在代谢组学中的应用
2.1气相色谱-质谱联用技术
2.2基于GC-MS、GC×GC-TOFMS的代谢组学技术平台
2.3代谢组学应用
2.4发展与展望
参考文献
第3章液相色谱及液相色谱-质谱联用技术在代谢组学研究中的应用
3.1液相色谱及液相色谱-质谱联用技术
3.2用于极性小分子分析的二维液相色谱分离系统
3.3液相色谱及液相色谱-质谱联用技术在代谢组学研究中的应用实例
参考文献
第4章超高效液相色谱-质谱及在代谢组学中的应用
4.1超高效液相色谱的理论基础
4.2超高效液相色谱与HPLC分析性能的比较
4.3超高效液相色谱在代谢组学中的应用
参考文献
第5章毛细管电泳-质谱联用技术在代谢组学研究中的应用
5.1毛细管电泳-质谱联用技术简介
5.2基于毛细管电泳-质谱联用技术的代谢组学平台
5.3毛细管电泳在代谢组学中的应用研究
参考文献
第6章核磁共振在代谢组学研究中的应用
6.1核磁共振波谱分析原理
6.2代谢组学中的核磁共振波谱分析方法
6.3核磁共振在代谢组学研究中的应用
6.4展望
参考文献
第7章代谢组学研究中常用的化学计量学方法
7.1数据预处理方法
7.2常用的模式识别方法
7.3数据库及专家系统
参考文献
第8章类脂和类脂组学
第9章代谢组学在疾病分型和标志物发现研究中的应用
第10章修饰核苷在癌症诊断和随访中的应用
第11章代谢组学在糖尿病研究中的应用
第12章代谢组学在营养学研究中的应用
第13章代谢组学与药物研究
第14章代谢组学在植物研究中的应用
第15章代谢组学在微生物学中的应用
第16章代谢组学在环境科学中的应用
书摘插图
第1章绪论
随着人类基因组测序工作的完成,基因功能的研究逐渐成为热点,随之出现了一系列的“组学”研究,包括研究转录过程的转录组学(transcriptomics)、研究某个生物体系中所有蛋白质及其功能的蛋白质组学(proteomics)及研究代谢产物的变化及代谢途径的代谢组学(metabolomics或metabonomics)(图1一1)。
代谢组学是众多组学中的一种,是随着生命科学的发展而发展起来的。与其他组学不同,代谢组学是通过考察生物体系(细胞、组织或生物体)受刺激或扰动后(如将某个特定的基因变异或环境变化后),其代谢产物的变化或其随时间的变化,来研究生物体系的一门科学。所谓代谢组(metabolome)是基因组的下游产物也是最终产物,是一些参与生物体新陈代谢、维持生物体正常功能和生长发育的小分子化合物的集合,主要是相对分子质量小于1000的内源性小分子。代谢组中代谢物的数量因生物物种不同而差异较大,据估计,植物王国中代谢物的数量在200 000种以上,单个植物的代谢物数量在5000~25000,甚至简单的拟南芥(Arabidopsis thaliana)也产生约5000种代谢产物,远远多于微生物中的代谢产物(约1500种)和动物中的代谢产物(约2500种)。实际上,在人体和动物中,由于还有共存的微生物代谢、食物及其代谢物本身的再降解,到目前为止,还不能估计出到底有多少种代谢产物,浓度分布范围有7~9个数量级。因此对代谢组学的研究,无论从分析平台、数据处理及其生物解释等方面均面临诸多挑战。本章对代谢组学发展的历史、国内外现状、研究方法、典型应用领域及研究热点等给予了介绍。
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