从“媒介”到“媒体”，视频网站以其内容的新颖、灵活、及时等特点吸引了越来越多的“眼球”。然而，由于中国互联网的基础网络环境的约束和政策法规的不健全，使得刚刚起步的视频网站存在着很多问题。
版权纠纷不断
2007年3月，因高价出手而知名的视频网站YouTube及刚刚接手不久的母公司Google被美国传媒巨头维亚康姆公司以“蓄意大规模侵犯版权”为由告上法庭，并索赔10亿美元，由此引发了对视频网站版权问题的关注。
同样，在国内，2007年7月，拥有《疯狂的石头》信息网络传播权的新传在线(北京)信息技术有限公司，将国内最大的播客(视频分享)网站“土豆网”告上法庭，并索赔15万元人民币，理由是“土豆网”的会员非法上传了《疯狂的石头》，供网友免费观看，成为国内视频网站版权纠纷第一案。
非法内容大行其道
大多数视频网站在发展初期，为了盲目追求点击率，发布一些涉黄、暴力的内容。而目前我国视频网站的主要用户为青少年，因此，不良信息的发布无疑有着很大的社会危害，也给企业的持续发展带来政策和道德方面的双重风险。
赔本赚吆喝
目前国内的视频网站，大多数都是依靠风险投资起家，虽然视频网站的点击率不断攀升，然而这却没有转化为相应的商业价值，致使视频网站在盈利问题上步履维艰。有关数据显示，整个网络视频行业能够盈亏持平的不足1%，整个行业99%以上的网站都是在亏损。
产品同质化严重
由于视频网站的视频制作成本要远远高于以文字内容为主的网站，所以多数视频网站中，大部分视频内容是依靠网友上传来获取片源。这就导致视频网站内容的同质化问题严重，使得用户在视频网站选择上不存在明显的倾向性。而随着用户个性化需求的不断增加以及竞争的日益激烈，同质化问题所带来的负面影响会日益明显。