身为谷歌CEO，同时又是苹果公司董事会董事，迫于外界压力，施密特选择在2009年8月3日结束他与苹果保持了三年的“婚姻”。
据称，卸任的直接原因是两家美国硅谷最具创新性的科技企业日渐形成的竞争关系，和美国联邦贸易委员会(FTC)正就两家公司董事会间的亲密关系是否违反反垄断法展开的调查。
施密特辞去董事一职，相信让两家公司的许多关联者都少了些心理包袱。但是，让施密特没料到的是，辞去苹果董事4天后又惹来另一个非议:施密特在苹果任职的三年里没收过工钱。
如果说施密特连续几年都是“1美元年薪CEO俱乐部”的典型代表还能让人理解，毕竟手握相当数量的股票和期权，每年都能享受巨额股票分红。从这一点而言，身为谷歌CEO的施密特“不差钱”，不要苹果的年薪还算正常，但连股票都不要，就有些匪夷所思了。
根据苹果1997年制订的薪酬计划，外部董事可以获得3万股苹果股票的认购权及5万美元年薪。苹果递交给监管机构的文件显示，施密特自2006年开始担任苹果董事以来，既不要年薪，也没要认股权。
不要苹果公司的钱，施密特要什么？
作为谷歌公司的领导人，施密特成为苹果董事似乎更符合中国人意识里的“阴谋论”，为了利益，打入敌人内部去，事实也似乎能印证这种揣测。
施密特2006年加入苹果董事会时，距离苹果推出iPhone（iPhone玩家论坛）还有5个月。此后一年多时间，谷歌宣布了开放的移动操作系统平台Android的研发计划。此外，正是施密特的督促，谷歌和苹果在一些业务上有着亲密的关系，比如谷歌与苹果合作开发Gmail和谷歌地图等服务的早期版本并应用于苹果iPhone手机。还比如，苹果的电视机顶盒能帮用户通过电视观看YouTube视频；苹果iPhone安装了谷歌搜索和地图应用；通过苹果软件套装iLife中的音视频应用，用户可直接将视频发布到谷歌旗下的视频共享网站YouTube；而iLife还能帮助用户加入谷歌AdSense计划，在自己的网站上显示谷歌广告并获得收入等等。
在一段合作的蜜月期之后，谷歌逐渐与苹果在边缘业务形成潜在竞争，这更加深了业界对施密特继续担任苹果董事的质疑。谷歌越来越多的基于互联网的软件应用开发举动，让业界看到了它对苹果领地的入侵，比如Chrome浏览器以及ChromeOS操作系统、音乐与视频服务、图片编辑器等。而基于谷歌系统软件的硬件产品，也与苹果的iPhone手机、电脑等硬件产品构成竞争。这些既合作又竞争的情形，都发生在施密特担任苹果董事的这三年。