反映肾功能的主要检查指标有以下几种：①内生肌酐清除率；②血尿素氮；③血肌酐；④血红蛋白和红细胞数；⑤尿比重；⑥尿渗透压；⑦尿酚红排泄试验等。其中以前3种最为重要。内生肌酐清除率、血尿素氮、血肌酐的指标主要反映肾小球的滤过功能，慢性肾衰的贫血是由肾实质损伤所导致的，其程度与肾功能的损害程度相平行。而尿比重、尿酚红排泄试验、尿渗透压是检查肾小管功能的主要指标，直接反映肾脏的浓缩功能。
平常人们最关注的肾功能检查，泛指血尿素氮及肌酐浓度的测定值。
(1)血尿素氮(BUN)：过去多采用血浆非蛋白氮(NPN)测定，NPN是指血浆蛋白以外的所有含氮化合物，包括尿素氮、尿酸、肌酸、肌酐、氨基酸、谷胱甘肽、铵等，其中，一些物质与肾功能无关或受肾外因素影响大，故目前已很少应用。BUN占NPN中的绝大多数，为50%以上，肾功能不全时其较迅速地明显增加，虽然也受一些肾外因素影响(如蛋白摄入量、胃肠道出血、高分解代谢、肝脏代谢能力以及尿量的多少等)，但方法简便，临床仍在广泛应用。BUN的正常值为2.9～7.5mmol/L(8～21mg/dl)，NPN的正常值为14.3～25mmol/L(20～35mg/dl) 。BUN和NPN的高低取决于人体蛋白质分解代谢与肾脏的排泄功能，当血中这两种物质分别超过7.5mmol/L和25mmol/L时，提示肾小球滤过率(GFR)已至少降到60%以下。
(2)血清肌酐(Scr)：其生成、代谢与排出受肾外影响因素很少，是较为理想的指标。红细胞中也含有肌酐。其正常值：苦味酸法为44～133μmol/L(0.8～1.5mg/dl)；酶法男性为53 ～106μmol/L(0.6～1.2mg/dl)，女性为44～97μmol/L(0.5～1.1mg/dl)。
在肾功能不全时，血肌酐水平增高。血中肌酐主要由肾小球滤过，肾小管分泌量很少，所以，血肌酐浓度与肾小球滤过功能呈反比关系。血肌酐的倒数值或对数值与GFR有线性相关。定时检查Scr，以其倒数值或对数值作纵坐标，时间为横坐标，可描出肾功能变化的斜率，可供判断病情进展状况与预后，观察药物疗效或制订治疗计划如安排造瘘透析时间等。实验证明，当GFR降低至35%左右时，虽NPN仍有低于25mmol/L者，而Scr则已全部超过正常范围。
血中NPN、BUN、Scr等含氮物质超过正常范围者，称为“氮质血症”。不论何种慢性、急性肾脏病，当其出现氮质血症时，有效肾单位往往已有60%～70%受损害，因此，对BUN、Scr测定为正常者，并不能除外肾功能不全。然而，这两项检查对于尿毒症的诊断、判断预后，却有重要意义，因为增高程度与病情严重性成正比。此外，肾前或肾后各种原因引起的少尿或无尿时，BUn、Scr亦可潴留而升高。各种因素所致人体蛋白分解代谢过多，也可引起氮质血症。
(3)内生肌酐清除率(Ccr)：由于肌酐是内源性物质，如无外源性大量摄入肉食、剧烈运动或肌肉疾病，它每日的生成量为20mg/kg或1mg/min，血浆中浓度与尿中排出量都较为恒定，是目前临床上最常用的方法。临床上Ccr的正常值：男性为140±27.2ml/min，女性为112±20.3ml/min；矫正后清除率(即国内以标准体表面积加以矫正)为80～100ml/min。Ccr随年龄变化而变化，每长10岁下降4ml/min。Ccr是目前临床上最常用的肾功能试验，它的降低程度基本上反映肾实质损害程度。一般认为，当降到正常值的80%时，表示肾小球滤过的功能已有减退，如降至51～70ml/min时示轻度损伤，降至31～50ml/min时示中度损伤，降至20ml/min 时即可出现尿毒症的症状。